63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2608 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 789 aa  1636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  62.41 
 
 		 787 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3274  hypothetical protein  40.73 
 
 		 910 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  32.59 
 
 		 207 aa  104  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  34.67 
 
 		 208 aa  101  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.11 
 
 		 212 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  30.53 
 
 		 203 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  31.09 
 
 		 875 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  35.52 
 
 		 211 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  35.12 
 
 		 213 aa  94  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 1054 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  32.02 
 
 		 209 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 220 aa  89  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  36.43 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  30.2 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  29.74 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  29.74 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  30.77 
 
 		 177 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  31.12 
 
 		 204 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  27.62 
 
 		 204 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  28 
 
 		 674 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  30.14 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  29.52 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.58 
 
 		 197 aa  80.5  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 177 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.58 
 
 		 197 aa  80.5  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  24.8 
 
 		 776 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  29.53 
 
 		 197 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  26.51 
 
 		 964 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  30.11 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  28.5 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  26.98 
 
 		 1297 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  29.89 
 
 		 181 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  30 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  48.54 
 
 		 286 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  30.46 
 
 		 187 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  29.79 
 
 		 253 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  28.72 
 
 		 181 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 189 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  29.57 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  30.3 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  21.74 
 
 		 335 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  25.9 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 196 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 182 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  25.64 
 
 		 743 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  22.98 
 
 		 295 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 264 aa  55.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  23.5 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  24.38 
 
 		 183 aa  55.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 264 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  35.04 
 
 		 290 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  23.75 
 
 		 359 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  25.52 
 
 		 296 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  25.62 
 
 		 322 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  26.14 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  22.96 
 
 		 746 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  21.28 
 
 		 367 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  39.29 
 
 		 989 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  27.62 
 
 		 323 aa  45.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>