64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0686 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  100 
 
 
204 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  93.63 
 
 
204 aa  400  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  93.14 
 
 
204 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  67.16 
 
 
204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  57.07 
 
 
212 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  95.12 
 
 
95 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  93.9 
 
 
95 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  41.24 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  37.82 
 
 
197 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  37.31 
 
 
197 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  37.31 
 
 
197 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  42.94 
 
 
335 aa  124  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  41.3 
 
 
177 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  41.3 
 
 
177 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  36.82 
 
 
204 aa  121  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  36.41 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  40.76 
 
 
177 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  38.58 
 
 
207 aa  118  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  43.32 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  39.88 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42.57 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  38.71 
 
 
177 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  44.57 
 
 
209 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 
181 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  39.02 
 
 
181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.92 
 
 
220 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  37.37 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  37.13 
 
 
269 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  33.88 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  34.98 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.44 
 
 
266 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  33.71 
 
 
245 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  32.35 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  33.49 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  30.37 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 
789 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.02 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  28.3 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  39.66 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  27.57 
 
 
875 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 
1054 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.31 
 
 
776 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.85 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.53 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  27.32 
 
 
674 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  29.39 
 
 
1297 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  35.48 
 
 
787 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.81 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  29.59 
 
 
323 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.11 
 
 
290 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  40.43 
 
 
743 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  26.7 
 
 
322 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  33.9 
 
 
311 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  24.64 
 
 
964 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  41.56 
 
 
746 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  53.66 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  26.29 
 
 
238 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  48.89 
 
 
989 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  27.17 
 
 
368 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  27.13 
 
 
296 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>