56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3658 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  37.36 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  35.56 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  31.69 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  30.53 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  27.7 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  32.93 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  30.05 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  28.65 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  30.27 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  31.49 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  30.39 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  30.39 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  30.27 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  30.86 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  28.57 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  32.2 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  38.66 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  32.43 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  32.04 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  32.43 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  33.7 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  29.26 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  29.26 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  26.42 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  33.82 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  33.33 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  32.94 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  28.8 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  29.15 
 
 		 875 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  28.41 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  28.25 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  30.53 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.06 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  28.28 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  25.68 
 
 		 674 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  28.44 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 1054 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  38.46 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  31.5 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  33.91 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  48.98 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  30.89 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  38.38 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  23.4 
 
 		 776 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  37.1 
 
 		 989 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  25.7 
 
 		 743 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  26.45 
 
 		 964 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  31.18 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>