61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3606 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  96.59 
 
 		 264 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  50.41 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  49.78 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  45.37 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  45.79 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  52.98 
 
 		 177 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  54.86 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  51.33 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  52.32 
 
 		 177 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  52.32 
 
 		 177 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  49.67 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  40.52 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  33.65 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  43.31 
 
 		 189 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  30.48 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  40.13 
 
 		 183 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  41.18 
 
 		 181 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.61 
 
 		 187 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  37.11 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  35.76 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.03 
 
 		 875 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  37.4 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  39.82 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  30.69 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  38.52 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  40.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  39.17 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  36.8 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  36 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  34.85 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  40.37 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  35.83 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  33.05 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.5 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  28.34 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  29.89 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  30.77 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  29.08 
 
 		 746 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  31.91 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.36 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  23.94 
 
 		 776 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.36 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 789 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  32.76 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  30.86 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  41.94 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  32.33 
 
 		 743 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 1054 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  36.75 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  30.64 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  25.27 
 
 		 964 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0832  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.45 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000773006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  27.75 
 
 		 367 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  36.76 
 
 		 1297 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  26.32 
 
 		 266 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  26.32 
 
 		 266 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  26.32 
 
 		 266 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>