47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3355 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  59.02 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  59.8 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  56.1 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  55.39 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  55.98 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  55.83 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  51.72 
 
 		 384 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  52.43 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  53.59 
 
 		 431 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  34.85 
 
 		 709 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  30.38 
 
 		 587 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  30.38 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  30.38 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  30.38 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  30.38 
 
 		 553 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  34.36 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  30.04 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  31.78 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  26.84 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  26.96 
 
 		 566 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  26.52 
 
 		 567 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  38.3 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  30.2 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  30.2 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  33.33 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  45.83 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  33.63 
 
 		 181 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  38.26 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  24.5 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 		 1054 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  35.8 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  25.89 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  25.89 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  33.87 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  28.1 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  29.63 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  39.62 
 
 		 964 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  28.08 
 
 		 588 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  29.71 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>