70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2430 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  77.51 
 
 		 209 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  77.03 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  50 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  50 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  50.48 
 
 		 181 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  49.04 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  45.71 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  44.71 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  50.71 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  47.62 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  42.38 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  46.19 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  46.3 
 
 		 189 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  46.41 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  45.63 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  41.29 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  44.56 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  44.32 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  39.35 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  43.32 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  43.09 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  41.62 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  41.71 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  31.92 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  38.82 
 
 		 253 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.97 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.15 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  33.64 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  34.05 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  34.05 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  34.97 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.66 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 789 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  55.66 
 
 		 286 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  37.16 
 
 		 335 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  34.11 
 
 		 187 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  30.52 
 
 		 875 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 264 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.44 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  30.04 
 
 		 674 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  31.38 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  31.82 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  34.21 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  36.13 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  41.41 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.98 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  34.21 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 1054 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  24.17 
 
 		 964 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  26.47 
 
 		 1297 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.55 
 
 		 776 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  42.17 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  40.96 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  28.21 
 
 		 787 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  30.05 
 
 		 353 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  29.35 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  28.86 
 
 		 368 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  26.6 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  39.18 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  31.03 
 
 		 746 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  32.14 
 
 		 588 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  27.36 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  46.94 
 
 		 989 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  26.11 
 
 		 367 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>