33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1434 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  94.74 
 
 		 95 aa  186  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  93.9 
 
 		 204 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  93.9 
 
 		 204 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  93.9 
 
 		 204 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  60.98 
 
 		 204 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  47.56 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  48.19 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  45.78 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  45.78 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  45.78 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  45.78 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  45.24 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  38.55 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  38.55 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  38.55 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  44.05 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  38.89 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  37.04 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  41.18 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.82 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  42.47 
 
 		 335 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  33.33 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  32.93 
 
 		 245 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  36.62 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.15 
 
 		 266 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  34.15 
 
 		 253 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  42.17 
 
 		 209 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>