54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01355 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  39.35 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  32.51 
 
 		 875 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  43.51 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  34.09 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  41.14 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  37.67 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  34.72 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  34.36 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  34.36 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  35.42 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  31.84 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  38.85 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 181 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  34.13 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  33.81 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  33.81 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  32.94 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  36.08 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  31.9 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 		 789 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  30.95 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  30.37 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  30.05 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  35.67 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  32.09 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  30.96 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  31.94 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  34.95 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.39 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  32.27 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.16 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  31.03 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  33.48 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  31.33 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  29.59 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  46 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  43.84 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  30.16 
 
 		 322 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  30.35 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  43.84 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  26.07 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  40.48 
 
 		 989 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  35.19 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  33.04 
 
 		 746 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  31.78 
 
 		 359 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>