67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4033 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 182 aa  373  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  67.96 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  67.4 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  61.83 
 
 		 189 aa  227  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  61.11 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  60.77 
 
 		 181 aa  220  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  55.49 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  55.49 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  55.49 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  53.3 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  50 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  55.49 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  49.76 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  48.8 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  46.41 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  41.4 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  37.56 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  35.68 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  38.18 
 
 		 322 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  37.02 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  36.42 
 
 		 323 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.07 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  37.65 
 
 		 238 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  34.15 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  38.3 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  34.76 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  36.32 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  33.81 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 264 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  38.46 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 264 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  31.19 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  31.19 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  30.37 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  31.71 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  32.53 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  28.17 
 
 		 875 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  39.18 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.15 
 
 		 776 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  42.35 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  30.23 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  36.75 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.41 
 
 		 588 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 789 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 1054 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  30.34 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  29.94 
 
 		 266 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  32.35 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  28.57 
 
 		 367 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  27.54 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  30.17 
 
 		 359 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  31.15 
 
 		 353 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  34.48 
 
 		 743 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  28.42 
 
 		 674 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  28.74 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  25.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  27.43 
 
 		 964 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  26.83 
 
 		 384 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  26.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  29.63 
 
 		 368 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  31.82 
 
 		 1297 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.04 
 
 		 787 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  22.73 
 
 		 746 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  34.48 
 
 		 989 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  25.83 
 
 		 709 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>