30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4092 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1177    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  32.34 
 
 		 177 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 177 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  31.84 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  31.84 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  30.24 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  32 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  31.22 
 
 		 183 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0716  hypothetical protein  29.03 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.43 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 182 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  38.61 
 
 		 208 aa  54.7  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  31.62 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  30.56 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  30.29 
 
 		 187 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  29.81 
 
 		 368 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 196 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  28 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  35.05 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  27.32 
 
 		 359 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  40.74 
 
 		 197 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  40.74 
 
 		 197 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  40.74 
 
 		 197 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  30 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  26 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  32.35 
 
 		 204 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  41.79 
 
 		 335 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>