79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1414 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  74.02 
 
 
197 aa  308  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  74.02 
 
 
197 aa  308  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  74.75 
 
 
197 aa  306  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  36.41 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  38.79 
 
 
208 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  38.24 
 
 
204 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  36.82 
 
 
204 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  35.63 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  38.37 
 
 
335 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  35.32 
 
 
204 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  33.98 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  33.98 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  35.44 
 
 
177 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  39.11 
 
 
212 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 
177 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  31.82 
 
 
220 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  33.72 
 
 
269 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  31.92 
 
 
209 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  33.18 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  31.84 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  32.93 
 
 
266 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  32.5 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  32.28 
 
 
245 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  31.13 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  35.84 
 
 
211 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  30.05 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  29.76 
 
 
181 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  47.62 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  29.58 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  30.81 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  26.42 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  29.38 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  42.34 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  27.93 
 
 
875 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  28 
 
 
322 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  39.81 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
789 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  35.19 
 
 
259 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  28.18 
 
 
964 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  33.55 
 
 
1297 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
1054 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  43.33 
 
 
989 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.43 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.05 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  39.76 
 
 
95 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  26.53 
 
 
367 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  44.05 
 
 
95 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
264 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  26.32 
 
 
674 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.03 
 
 
290 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  49.12 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  25.68 
 
 
323 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  30.95 
 
 
787 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  33.03 
 
 
431 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27 
 
 
776 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  35.14 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  26.02 
 
 
384 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  26.67 
 
 
359 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  25.25 
 
 
295 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  26.92 
 
 
368 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  27.27 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  27.27 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  27.27 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  29.25 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  44.68 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  44.68 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  32.35 
 
 
588 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  38.78 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.78 
 
 
743 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  38.3 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  26.26 
 
 
353 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  39.68 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  38.1 
 
 
227 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>