64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1096 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  100 
 
 		 204 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  94.12 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  93.14 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  66.18 
 
 		 204 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  57.07 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  95.12 
 
 		 95 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  93.9 
 
 		 95 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  39.69 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  37.86 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  39.09 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  37.37 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  36.84 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  36.84 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  37.07 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  37.07 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  40.34 
 
 		 335 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  39.67 
 
 		 177 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  35.32 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  38.59 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  43.09 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  41.97 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  35.71 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.97 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  43.04 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  41.8 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  33.33 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  34.07 
 
 		 253 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  34.34 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.25 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  35.09 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  34.63 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  33.71 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  30.05 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  35.48 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 		 789 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  29.25 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  27.7 
 
 		 875 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  29.39 
 
 		 1297 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  38.26 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  27.32 
 
 		 674 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.97 
 
 		 787 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  26.7 
 
 		 776 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 1054 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.57 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  28.64 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.23 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  34.11 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  26.63 
 
 		 322 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  29.71 
 
 		 743 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  27.89 
 
 		 964 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  53.19 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  48.89 
 
 		 989 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  67.86 
 
 		 746 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  28.7 
 
 		 238 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  26.34 
 
 		 295 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>