21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1332 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  55.15 
 
 		 234 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  55.8 
 
 		 236 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  49.48 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  42.11 
 
 		 264 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 264 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  38.27 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  39.3 
 
 		 237 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  40.13 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  38.65 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  36.76 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  35.52 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  33.03 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  32.28 
 
 		 989 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  33.96 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  25.58 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  30.3 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>