49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0515 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  420  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  42.36 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  44.22 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  43.56 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  45.16 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  43.88 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  38.27 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  44.26 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  38.73 
 
 		 290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  41.76 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  37.63 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  42.47 
 
 		 239 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  37.56 
 
 		 264 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  34.08 
 
 		 989 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  35.02 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  39.19 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  52.83 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  50.88 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  50.88 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  50.94 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  50.88 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  50.94 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  37.19 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  53.33 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  47.92 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  39.77 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  49.12 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  49.12 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  39.39 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  34.41 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.95 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  48.98 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  53.19 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  53.19 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  52.38 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  53.66 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  43.14 
 
 		 1297 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  33.03 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  45.45 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  40.68 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  34.85 
 
 		 776 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 1054 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>