21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1277 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  93.39 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  47.28 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  52.94 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  44.26 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  42.76 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  37.02 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  36.76 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  37.06 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  37.57 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  35.98 
 
 		 264 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  45.83 
 
 		 989 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  32.32 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  33.65 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  30.57 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  28.57 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  28.57 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>