46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4775 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  81.71 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  57.84 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.37 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.37 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  47.29 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  47.29 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  45.71 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  45.1 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  44.96 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 196 aa  95.5  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  40.97 
 
 		 187 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 181 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  41.67 
 
 		 181 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  40.15 
 
 		 183 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 182 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  33.74 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  37.12 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  38.78 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  32.19 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  35.19 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  36.13 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  35.16 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  37 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  32.32 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  32.41 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  32.41 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  29.51 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  32.81 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  33.06 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  32.23 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  36.13 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  28.9 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  33.6 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  30.89 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  32.5 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  32.31 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  31.03 
 
 		 743 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  32.71 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  32 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  35.19 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  29.66 
 
 		 245 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>