57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5850 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  47.6 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  44.29 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  42.72 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  41.29 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  39.71 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  40.2 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  40.84 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  40.51 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  38.86 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 182 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  38.97 
 
 		 183 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  37.07 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  36.92 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  60 
 
 		 286 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  35.44 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  37.44 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  34.36 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  34.36 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  36.67 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  35.11 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.57 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  35.45 
 
 		 245 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 177 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  36.41 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  42.28 
 
 		 269 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  32.37 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  31.82 
 
 		 875 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  34.04 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  32.35 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  35.84 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  35.33 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 		 789 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  33.16 
 
 		 674 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  32.58 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  32.58 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  41.74 
 
 		 290 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  31.03 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  29.74 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  28.97 
 
 		 323 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  26.04 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  29.69 
 
 		 743 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  27.51 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  27.64 
 
 		 322 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  27.73 
 
 		 776 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 		 1054 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  26.13 
 
 		 964 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  37.5 
 
 		 1297 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  34.59 
 
 		 787 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  28.9 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>