55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3679 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  100 
 
 		 203 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  42.79 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  42.72 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  42.16 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  44.21 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  40.38 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  40.87 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  37.86 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  38.92 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  38.14 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  36.41 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  37.09 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  37.86 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  36.14 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  38.89 
 
 		 269 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  39.88 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  34.78 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 		 789 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  35.64 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 182 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  34.16 
 
 		 177 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  34.16 
 
 		 177 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  33.87 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  33.87 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  38.65 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  36.67 
 
 		 253 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  31.13 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  30.37 
 
 		 875 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  53.47 
 
 		 286 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  32.94 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  33.14 
 
 		 266 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  35.08 
 
 		 183 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  32.98 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  33.33 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  31.98 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.21 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.4 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  48.57 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  25.77 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  29.86 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  39.84 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  30.64 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  27.68 
 
 		 674 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  36.13 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  25.24 
 
 		 964 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  48.57 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 1054 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  27.23 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  26.53 
 
 		 743 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  30.43 
 
 		 776 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>