16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0168 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  99.48 
 
 
765 aa  1593    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  83.25 
 
 
766 aa  1278    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  100 
 
 
765 aa  1598    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  99.35 
 
 
765 aa  1590    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  45.25 
 
 
740 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  54.62 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  32.18 
 
 
746 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  25.6 
 
 
776 aa  217  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  29.57 
 
 
751 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  28.66 
 
 
776 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  31.84 
 
 
425 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  28.85 
 
 
418 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  24.35 
 
 
875 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  24.47 
 
 
674 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  20.9 
 
 
1054 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  37.7 
 
 
224 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>