16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0806 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  99.87 
 
 		 765 aa  1596    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  83.51 
 
 		 766 aa  1279    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  99.35 
 
 		 765 aa  1590    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  100 
 
 		 765 aa  1599    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  45.58 
 
 		 740 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  55.01 
 
 		 497 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  32.31 
 
 		 746 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  25.66 
 
 		 776 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  29.4 
 
 		 751 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  28.66 
 
 		 776 aa  180  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  32.11 
 
 		 425 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  29.19 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  24.68 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  21.36 
 
 		 1054 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  24.47 
 
 		 674 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  37.7 
 
 		 224 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>