17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6128 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6128  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0831605  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  94.25 
 
 
746 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7016  hypothetical protein  29.2 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03734  hypothetical protein  30.65 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197707  normal  0.88043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 
740 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0057  hypothetical protein  27.41 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2503  M23 peptidase domain-containing protein  37.7 
 
 
766 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  37.7 
 
 
765 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  37.7 
 
 
765 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  37.7 
 
 
765 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2500  M23 peptidase domain-containing protein  32.58 
 
 
497 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.453471  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  35.37 
 
 
875 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  43.55 
 
 
425 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
1054 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  50 
 
 
751 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  48 
 
 
776 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  38.98 
 
 
827 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.279445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>