19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3381 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 655 aa  1360    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0962  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.7 
 
 		 285 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1554  hypothetical protein  37.13 
 
 		 279 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0960  AmpD (negative regulator of AmpC)  37.66 
 
 		 241 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0865958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  31.61 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  25.54 
 
 		 751 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0335  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  51.2  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0316  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1789  negative regulator of AmpC, AmpD  32 
 
 		 219 aa  50.8  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3957  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0959581  normal  0.0994199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  30.72 
 
 		 776 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.42 
 
 		 265 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1073  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.52 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0771  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.73 
 
 		 229 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  30 
 
 		 818 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00775  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  36.21 
 
 		 191 aa  44.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0341062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1400  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.16 
 
 		 268 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  28.12 
 
 		 425 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1444  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.16 
 
 		 268 aa  44.3  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>