20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1554 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0962  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.38 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3381  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.13 
 
 		 655 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26749  normal  0.167867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2813  hypothetical protein  30.72 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0960  AmpD (negative regulator of AmpC)  27.75 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0865958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3051  negative regulator of AmpC, AmpD  38.2 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.8874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.64 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0860  hypothetical protein  33.63 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0670  hypothetical protein  33.04 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.996768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1444  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.94 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16069  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1400  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.94 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1073  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.08 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.04 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1916  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.71 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.8 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0954  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.93 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1735  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.52 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  0.0896689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2038  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 196 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002548  AmpD protein  23.21 
 
 		 183 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>