28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1943 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  100 
 
 		 464 aa  955    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  38.74 
 
 		 709 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  29.53 
 
 		 565 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  31.92 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  31.92 
 
 		 567 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  29.49 
 
 		 587 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  29.49 
 
 		 587 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  29.49 
 
 		 553 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  29.49 
 
 		 587 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  29.49 
 
 		 587 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  31.58 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  31.17 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  33.16 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  32.08 
 
 		 245 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  33.33 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  30.23 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  34.11 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  34.11 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  34.11 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  28.57 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  27.75 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  33.5 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  31.62 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  30.71 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  33.33 
 
 		 183 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 189 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 177 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  40.74 
 
 		 208 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>