More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1821 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1821  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  100 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0659375  normal  0.794818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17730  shikimate 5-dehydrogenase  65.31 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1348  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  60.22 
 
 		 276 aa  251  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2017  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  55.67 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0523182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1693  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  59.55 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2381  shikimate 5-dehydrogenase  53.46 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  50.9 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2043  shikimate-5-dehydrogenase  52.86 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0503068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2012  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  46.27 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2349  shikimate 5-dehydrogenase  46.15 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2396  shikimate 5-dehydrogenase  46.15 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6090  shikimate 5-dehydrogenase  53.18 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2138  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  49.28 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2390  shikimate 5-dehydrogenase  45.79 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.450055  normal  0.0474327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3760  shikimate 5-dehydrogenase  45.02 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2275  shikimate dehydrogenase  45.98 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1327  shikimate dehydrogenase  49.44 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.364317  normal  0.306318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3155  shikimate-5-dehydrogenase  47.78 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0429  shikimate 5-dehydrogenase  40.88 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3294  shikimate-5-dehydrogenase  42.28 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000542793  normal  0.0771139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3072  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  52.69 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347553  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2323  shikimate-5-dehydrogenase  42.91 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.326735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1978  shikimate-5-dehydrogenase  44.4 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2067  shikimate dehydrogenase  46.95 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.358861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3875  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 327 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.352799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2410  shikimate dehydrogenase  46.4 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12573  shikimate 5-dehydrogenase  40.15 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00059601  normal  0.0993621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5262  shikimate 5-dehydrogenase  42.12 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16330  shikimate 5-dehydrogenase  40.3 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15300  shikimate 5-dehydrogenase  43.57 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.684406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2643  shikimate 5-dehydrogenase  42.03 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12690  shikimate 5-dehydrogenase  39.35 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1697  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  44.15 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.271026  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  31.34 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1831  shikimate-5-dehydrogenase  39.02 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1822  shikimate-5-dehydrogenase  38.97 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  30.55 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  31.95 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2304  shikimate 5-dehydrogenase  35.11 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  32 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  32 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2675  shikimate 5-dehydrogenase  35.66 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  37.45 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1163  shikimate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3211  shikimate dehydrogenase  44 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  29.56 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  29.56 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  28.73 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1798  shikimate 5-dehydrogenase  29.02 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0911  shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  37.5 
 
 		 397 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  29.17 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  34.66 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18961  shikimate 5-dehydrogenase  26.6 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  36.59 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  37.24 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1558  shikimate dehydrogenase  35.56 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  30.25 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  26.74 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  31.16 
 
 		 1611 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  30.53 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4753  shikimate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30051  shikimate 5-dehydrogenase  31.06 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45535  predicted protein  33.1 
 
 		 835 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  31.14 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18961  shikimate 5-dehydrogenase  26.16 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  32.49 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2724  shikimate 5-dehydrogenase  32 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  30.08 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2746  shikimate 5-dehydrogenase  29.59 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0290691  normal  0.306598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  28.94 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1732  shikimate 5-dehydrogenase  27.08 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.035063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2830  shikimate dehydrogenase  34.03 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0523448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  31.07 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  25.72 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0689  shikimate 5-dehydrogenase  27.65 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  27.17 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0743  shikimate 5-dehydrogenase  27.74 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  24.01 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1362  shikimate dehydrogenase  37.78 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.758988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  27.74 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1564  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12500  shikimate 5-dehydrogenase  30.42 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2467  shikimate 5-dehydrogenase  28.92 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502359  hitchhiker  0.0000000000141391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  32.63 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  31.05 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06560  shikimate 5-dehydrogenase  30.25 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18411  shikimate / quinate 5-dehydrogenase  26.57 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.611208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6119  shikimate 5-dehydrogenase  31.9 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  36.02 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2187  shikimate 5-dehydrogenase  27.21 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  36.02 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  29.26 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>