More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45535 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45535  predicted protein  100 
 
 		 835 aa  1726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370246  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  31.57 
 
 		 1611 aa  271  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01132  Negative-acting regulatory proteinPutative uncharacterized proteinRepressor protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00784]  30.25 
 
 		 901 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0914062 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  28.55 
 
 		 1571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08886  repressor protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02700)  29.06 
 
 		 804 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.965911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  32.76 
 
 		 273 aa  139  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_408  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 286 aa  129  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  28.46 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1163  shikimate 5-dehydrogenase  31.44 
 
 		 269 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1558  shikimate dehydrogenase  35.37 
 
 		 295 aa  124  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0442  shikimate 5-dehydrogenase  32.63 
 
 		 286 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.437298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  32.78 
 
 		 301 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2605  shikimate 5-dehydrogenase  36 
 
 		 457 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_002936  DET0465  shikimate 5-dehydrogenase  32.98 
 
 		 286 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  31.83 
 
 		 286 aa  121  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  31.83 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0088  shikimate 5-dehydrogenase  33.45 
 
 		 271 aa  119  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  31.6 
 
 		 280 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  32.65 
 
 		 275 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  30.17 
 
 		 277 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  30.26 
 
 		 613 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  30.23 
 
 		 315 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  29.67 
 
 		 277 aa  114  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0649  bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase protein  30.33 
 
 		 478 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  30.38 
 
 		 277 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  30.18 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  30.56 
 
 		 298 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  30.17 
 
 		 277 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  29.93 
 
 		 268 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  29.93 
 
 		 268 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0663  shikimate 5-dehydrogenase  28.95 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  30.17 
 
 		 277 aa  111  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  29.83 
 
 		 277 aa  111  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  30.14 
 
 		 308 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  30.27 
 
 		 277 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  29.83 
 
 		 277 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  29.9 
 
 		 279 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  29.93 
 
 		 278 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1998  shikimate dehydrogenase  32.07 
 
 		 269 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  32.78 
 
 		 286 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  33.11 
 
 		 291 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  34.11 
 
 		 290 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  32.14 
 
 		 298 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  30.17 
 
 		 284 aa  109  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  26.42 
 
 		 688 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.572044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  34 
 
 		 290 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  29.83 
 
 		 277 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  27.62 
 
 		 473 aa  108  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  30.84 
 
 		 288 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  30.84 
 
 		 288 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06730  shikimate 5-dehydrogenase  30.43 
 
 		 244 aa  107  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3537  shikimate 5-dehydrogenase  31.6 
 
 		 295 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.784567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  29.41 
 
 		 279 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0805  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  31.52 
 
 		 269 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.108748  normal  0.164141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  33.22 
 
 		 298 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  33.22 
 
 		 298 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  29.87 
 
 		 289 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2671  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 279 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  32.36 
 
 		 276 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2721  shikimate 5-dehydrogenase  30.55 
 
 		 286 aa  104  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2226  shikimate 5-dehydrogenase  34.88 
 
 		 269 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  30.93 
 
 		 288 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0880  shikimate dehydrogenase  30.69 
 
 		 262 aa  103  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2746  shikimate 5-dehydrogenase  30.8 
 
 		 288 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0290691  normal  0.306598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2895  shikimate 5-dehydrogenase  30.88 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0777149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0656  shikimate 5-dehydrogenase  29.9 
 
 		 297 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  32.04 
 
 		 298 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4285  shikimate 5-dehydrogenase  34.72 
 
 		 282 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2043  shikimate-5-dehydrogenase  34.81 
 
 		 275 aa  101  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0503068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2724  shikimate 5-dehydrogenase  30.29 
 
 		 270 aa  101  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1271  shikimate 5-dehydrogenase  35.21 
 
 		 360 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.945829  normal  0.49023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  28.91 
 
 		 277 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1732  shikimate 5-dehydrogenase  29.53 
 
 		 305 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.035063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2359  shikimate 5-dehydrogenase  31.1 
 
 		 277 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1489  shikimate 5-dehydrogenase  34.43 
 
 		 278 aa  100  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.06753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1234  shikimate 5-dehydrogenase  30.53 
 
 		 279 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2467  shikimate 5-dehydrogenase  29.32 
 
 		 288 aa  99.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502359  hitchhiker  0.0000000000141391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2281  shikimate 5-dehydrogenase  33.1 
 
 		 282 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.010499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1504  quinate/shikimate dehydrogenase  28.38 
 
 		 288 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1327  shikimate dehydrogenase  33.45 
 
 		 312 aa  99  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.364317  normal  0.306318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1819  shikimate 5-dehydrogenase  34.28 
 
 		 271 aa  98.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.244145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  29.87 
 
 		 277 aa  98.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  32.55 
 
 		 292 aa  98.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01661  quinate/shikimate 5-dehydrogenase, NAD(P)-binding  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1950  Quinate/shikimate dehydrogenase  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.210326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1767  shikimate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1939  quinate/shikimate dehydrogenase  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2408  quinate/shikimate dehydrogenase  28.81 
 
 		 288 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.419065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3937  shikimate 5-dehydrogenase  30.74 
 
 		 285 aa  98.6  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1773  quinate/shikimate dehydrogenase  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  29.9 
 
 		 279 aa  98.2  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1895  quinate/shikimate dehydrogenase  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01650  hypothetical protein  28.86 
 
 		 288 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1908  quinate/shikimate dehydrogenase  28.52 
 
 		 288 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  33.33 
 
 		 283 aa  98.2  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46700  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.62 
 
 		 271 aa  97.8  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1829  shikimate 5-dehydrogenase  31.32 
 
 		 282 aa  97.8  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037769 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1654  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  30.13 
 
 		 290 aa  97.4  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.910773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  27.91 
 
 		 286 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>