More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_08886 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_08886  repressor protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02700)  100 
 
 
804 aa  1674    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.965911  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01132  Negative-acting regulatory proteinPutative uncharacterized proteinRepressor protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00784]  41.44 
 
 
901 aa  592  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0914062 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  28.45 
 
 
1611 aa  288  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  28.52 
 
 
1571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64420  predicted protein  23.36 
 
 
813 aa  194  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0116008 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45535  predicted protein  29.06 
 
 
835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370246  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30813  predicted protein  27.3 
 
 
309 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.401981 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  23.12 
 
 
688 aa  90.9  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.572044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  24.53 
 
 
288 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_408  shikimate 5-dehydrogenase  26.93 
 
 
286 aa  87.4  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5262  shikimate 5-dehydrogenase  28.95 
 
 
285 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  27.33 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1732  shikimate 5-dehydrogenase  26.73 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.035063 
 
 
-
 
NC_002936  DET0465  shikimate 5-dehydrogenase  26.96 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.65 
 
 
517 aa  83.2  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0442  shikimate 5-dehydrogenase  26.96 
 
 
286 aa  82  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.437298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  28.04 
 
 
297 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  25.08 
 
 
290 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  24.46 
 
 
277 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  24.77 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1889  shikimate 5-dehydrogenase  23.33 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0693  shikimate 5-dehydrogenase  24.12 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324204  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01137  Quinate dehydrogenase (EC 1.1.1.24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P25415]  26.5 
 
 
329 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.646628  normal  0.26326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  24.92 
 
 
275 aa  77  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  24.84 
 
 
277 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  28.75 
 
 
283 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1109  shikimate 5-dehydrogenase  27.21 
 
 
285 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0022  shikimate dehydrogenase  25.24 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301777  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0693  shikimate 5-dehydrogenase  23.79 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0110194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  26.45 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  25.93 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  23.1 
 
 
273 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  24.18 
 
 
277 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  24.6 
 
 
277 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  24.18 
 
 
277 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  28.22 
 
 
280 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  24.18 
 
 
308 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  25.38 
 
 
292 aa  73.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  24.18 
 
 
277 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  24.18 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  23.49 
 
 
284 aa  72  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  25.82 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  25.39 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0689  shikimate 5-dehydrogenase  24.26 
 
 
285 aa  70.5  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  24.68 
 
 
277 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2977  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.73 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  28.31 
 
 
301 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  25.16 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  25 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2138  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  29.45 
 
 
273 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  25 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0006  shikimate 5-dehydrogenase  25.52 
 
 
291 aa  69.3  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000629471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  26.49 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  28.74 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6119  shikimate 5-dehydrogenase  26.44 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0040  shikimate 5-dehydrogenase  26.56 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0102694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  28.74 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  23.22 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2504  shikimate dehydrogenase  25.87 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  22.02 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  22.02 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1281  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  23.84 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  23.8 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0361  shikimate 5-dehydrogenase  28.43 
 
 
275 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0156033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3480  shikimate 5-dehydrogenase  25.58 
 
 
279 aa  67.4  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  25.16 
 
 
277 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0004  shikimate 5-dehydrogenase  26.33 
 
 
286 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3294  shikimate-5-dehydrogenase  25.91 
 
 
279 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000542793  normal  0.0771139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  22.44 
 
 
298 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1163  shikimate 5-dehydrogenase  20.43 
 
 
269 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2830  shikimate dehydrogenase  24.43 
 
 
289 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0523448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1314  shikimate 5-dehydrogenase  28.16 
 
 
311 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  23.62 
 
 
278 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0120  shikimate 5-dehydrogenase  27.48 
 
 
296 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3963  shikimate 5-dehydrogenase  28.97 
 
 
275 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0106492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  21.34 
 
 
280 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18961  shikimate 5-dehydrogenase  25.16 
 
 
285 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0321  shikimate 5-dehydrogenase  28.8 
 
 
273 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3877  shikimate 5-dehydrogenase  28.8 
 
 
273 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000561624  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  22.51 
 
 
279 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2611  shikimate 5-dehydrogenase  24.39 
 
 
305 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0622  shikimate 5-dehydrogenase  28.8 
 
 
273 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482333  normal  0.0381897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1829  shikimate 5-dehydrogenase  26.07 
 
 
282 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2721  shikimate 5-dehydrogenase  27.53 
 
 
286 aa  65.1  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3021  shikimate 5-dehydrogenase  24.09 
 
 
305 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  27.94 
 
 
291 aa  64.7  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  24.46 
 
 
286 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03132  dehydroshikimate reductase, NAD(P)-binding  27.14 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000370296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0432  shikimate 5-dehydrogenase  27.14 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000304625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4753  shikimate 5-dehydrogenase  25.95 
 
 
285 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  24.39 
 
 
298 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3784  shikimate 5-dehydrogenase  27.46 
 
 
275 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21871  shikimate 5-dehydrogenase  22.57 
 
 
311 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1798  shikimate 5-dehydrogenase  23.44 
 
 
286 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0589  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  27.17 
 
 
253 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0196  shikimate 5-dehydrogenase  24.58 
 
 
278 aa  63.9  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0574  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  27.17 
 
 
253 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000629115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03083  hypothetical protein  27.14 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3475  shikimate 5-dehydrogenase  27.14 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000134858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0432  shikimate 5-dehydrogenase  27.14 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  hitchhiker  0.00828747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>