More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01137 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01137  Quinate dehydrogenase (EC 1.1.1.24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P25415]  100 
 
 
329 aa  678    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.646628  normal  0.26326 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30813  predicted protein  41.46 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  32.87 
 
 
1611 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2012  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  31.08 
 
 
286 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  29.86 
 
 
298 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  26.69 
 
 
289 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  32.87 
 
 
1571 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1385  quinate/shikimate dehydrogenase  30.48 
 
 
289 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0805  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  26.14 
 
 
269 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.108748  normal  0.164141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  28.9 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  28.87 
 
 
279 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  27.72 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1327  shikimate dehydrogenase  31.49 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.364317  normal  0.306318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  29.93 
 
 
315 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  26.48 
 
 
279 aa  86.7  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2408  quinate/shikimate dehydrogenase  30.36 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.419065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1504  quinate/shikimate dehydrogenase  29.22 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01661  quinate/shikimate 5-dehydrogenase, NAD(P)-binding  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1950  Quinate/shikimate dehydrogenase  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.210326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1895  quinate/shikimate dehydrogenase  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1939  quinate/shikimate dehydrogenase  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1773  quinate/shikimate dehydrogenase  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2275  shikimate dehydrogenase  30.2 
 
 
286 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01650  hypothetical protein  29.22 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  28.53 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  27.09 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1732  shikimate 5-dehydrogenase  27.48 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.035063 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1908  quinate/shikimate dehydrogenase  28.9 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  27.33 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  28.23 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  30.03 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2304  shikimate 5-dehydrogenase  28.67 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0708  shikimate dehydrogenase  26.62 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01132  Negative-acting regulatory proteinPutative uncharacterized proteinRepressor protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00784]  26.99 
 
 
901 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0914062 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21871  shikimate 5-dehydrogenase  22.82 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  23.69 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  27.49 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1314  shikimate 5-dehydrogenase  23.08 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2675  shikimate 5-dehydrogenase  27.65 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1889  shikimate 5-dehydrogenase  27.91 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  24.91 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0663  shikimate 5-dehydrogenase  25.4 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1345  quinate/shikimate 5-dehydrogenase  26.12 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.786263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  26.67 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  26.67 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0120  shikimate 5-dehydrogenase  35.5 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0483  shikimate 5-dehydrogenase  35.15 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  22.93 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0743  shikimate 5-dehydrogenase  26.37 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08886  repressor protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02700)  26.5 
 
 
804 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.965911  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  28.92 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2381  shikimate 5-dehydrogenase  29.59 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  28.94 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2043  shikimate-5-dehydrogenase  30 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0503068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2390  shikimate 5-dehydrogenase  30.34 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.450055  normal  0.0474327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  27.88 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0088  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  26.53 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  28.35 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0693  shikimate 5-dehydrogenase  25.17 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  26.53 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  26.41 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  26.43 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2349  shikimate 5-dehydrogenase  30 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  28.42 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2396  shikimate 5-dehydrogenase  30 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1697  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  29.19 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.271026  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1654  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  26.57 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.910773  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30051  shikimate 5-dehydrogenase  25.93 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2192  shikimate 5-dehydrogenase  30.45 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0253  shikimate 5-dehydrogenase  24.39 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6119  shikimate 5-dehydrogenase  27.69 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2840  shikimate 5-dehydrogenase  30.29 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  26.94 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1984  quinate/shikimate dehydrogenase  29.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169212 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0781  shikimate 5-dehydrogenase  29.41 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.015906  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1455  quinate/shikimate dehydrogenase  29.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.206578  normal  0.118327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1471  quinate/shikimate dehydrogenase  29.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0124621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1490  quinate/shikimate dehydrogenase  29.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0135386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4753  shikimate 5-dehydrogenase  31.15 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2359  shikimate 5-dehydrogenase  29.84 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2226  shikimate 5-dehydrogenase  29.35 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1813  quinate/shikimate dehydrogenase  29.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.648856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17730  shikimate 5-dehydrogenase  27.8 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  26.83 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  28.47 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1348  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  27.74 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  29.59 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  27.18 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06730  shikimate 5-dehydrogenase  37.12 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  24.83 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  28.09 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  32.76 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  34.48 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2323  shikimate-5-dehydrogenase  32.58 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.326735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1797  shikimate 5-dehydrogenase  27.62 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.910555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  33.53 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0693  shikimate 5-dehydrogenase  24.48 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0110194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  33.91 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5454  shikimate 5-dehydrogenase  28.7 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>