More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2012 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2012  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  100 
 
 		 286 aa  560  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2275  shikimate dehydrogenase  69.23 
 
 		 286 aa  354  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17730  shikimate 5-dehydrogenase  47.21 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3029  shikimate 5-dehydrogenase  45.68 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2017  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  47.57 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0523182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1348  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  46.55 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2138  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  47.55 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2381  shikimate 5-dehydrogenase  43.98 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2043  shikimate-5-dehydrogenase  48.67 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0503068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1697  shikimate dehydrogenase substrate binding subunit  45.49 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.271026  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1821  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  46.27 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0659375  normal  0.794818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6090  shikimate 5-dehydrogenase  48.48 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3294  shikimate-5-dehydrogenase  44.91 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000542793  normal  0.0771139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1693  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  47.21 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1327  shikimate dehydrogenase  46.59 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.364317  normal  0.306318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2390  shikimate 5-dehydrogenase  43.89 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.450055  normal  0.0474327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2323  shikimate-5-dehydrogenase  43.07 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.326735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2349  shikimate 5-dehydrogenase  43.51 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2396  shikimate 5-dehydrogenase  43.51 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12690  shikimate 5-dehydrogenase  43.17 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12573  shikimate 5-dehydrogenase  43.4 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00059601  normal  0.0993621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1978  shikimate-5-dehydrogenase  42.47 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3760  shikimate 5-dehydrogenase  43.51 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16330  shikimate 5-dehydrogenase  42.91 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3211  shikimate dehydrogenase  44.87 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5262  shikimate 5-dehydrogenase  42.64 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2067  shikimate dehydrogenase  45.02 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.358861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3875  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.352799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0429  shikimate 5-dehydrogenase  38.49 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3072  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  47.04 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347553  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3155  shikimate-5-dehydrogenase  42.75 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2410  shikimate dehydrogenase  42.91 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2643  shikimate 5-dehydrogenase  41.98 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1831  shikimate-5-dehydrogenase  42.53 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15300  shikimate 5-dehydrogenase  43.4 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.684406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1822  shikimate-5-dehydrogenase  42.53 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  28.84 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01137  Quinate dehydrogenase (EC 1.1.1.24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P25415]  31.08 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.646628  normal  0.26326 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  28.68 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  28.68 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  28.09 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  28.73 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3109  shikimate 5-dehydrogenase  31.97 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18411  shikimate / quinate 5-dehydrogenase  29.17 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.611208 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  31 
 
 		 1611 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  25.26 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1314  shikimate 5-dehydrogenase  27.64 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  32.83 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21871  shikimate 5-dehydrogenase  28.06 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  29.48 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  28.73 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1163  shikimate 5-dehydrogenase  25.56 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2840  shikimate 5-dehydrogenase  32.12 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2226  shikimate 5-dehydrogenase  32.46 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  33.96 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30813  predicted protein  28.06 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  28.67 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1362  shikimate dehydrogenase  36.8 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.758988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  29.89 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  27.99 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  27.55 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  27.48 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0088  shikimate 5-dehydrogenase  32.47 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18961  shikimate 5-dehydrogenase  23.53 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0571  shikimate 5-dehydrogenase  31.95 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18961  shikimate 5-dehydrogenase  23.79 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  25.66 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  27.04 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  25.88 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1998  shikimate dehydrogenase  30.15 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  29.48 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  28.25 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  28.57 
 
 		 1571 aa  89.7  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  31.46 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0465  shikimate 5-dehydrogenase  28.73 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  29.92 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0442  shikimate 5-dehydrogenase  27.14 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.437298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  30.5 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3211  shikimate 5-dehydrogenase  29.08 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  23.97 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_408  shikimate 5-dehydrogenase  27.55 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  31.88 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1590  shikimate 5-dehydrogenase  31.16 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  25.81 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2671  shikimate 5-dehydrogenase  31.41 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  25.94 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2932  shikimate 5-dehydrogenase  35.38 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00976663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2537  shikimate 5-dehydrogenase  35.61 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2304  shikimate 5-dehydrogenase  30.37 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0253  shikimate 5-dehydrogenase  23.81 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2895  shikimate 5-dehydrogenase  31.42 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0777149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2675  shikimate 5-dehydrogenase  30.37 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1654  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  29.04 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.910773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>