More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0006 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0006  shikimate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000629471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  49.82 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3937  shikimate 5-dehydrogenase  50.18 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4263  shikimate 5-dehydrogenase  49.29 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43866  normal  0.585644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0004  shikimate 5-dehydrogenase  49.1 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3211  shikimate 5-dehydrogenase  48.03 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1829  shikimate 5-dehydrogenase  46.93 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037769 
 
 
-
 
NC_004310  BR2069  shikimate 5-dehydrogenase  48.73 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1989  shikimate 5-dehydrogenase  48.73 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3480  shikimate 5-dehydrogenase  44.36 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1234  shikimate 5-dehydrogenase  45.96 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2895  shikimate 5-dehydrogenase  45.02 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0777149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2671  shikimate 5-dehydrogenase  43.82 
 
 		 279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1109  shikimate 5-dehydrogenase  44.32 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1302  shikimate 5-dehydrogenase  42.7 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2977  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.96 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3919  shikimate 5-dehydrogenase  43.01 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  40.97 
 
 		 284 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2537  shikimate 5-dehydrogenase  44.09 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1809  shikimate dehydrogenase  43.48 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4803  shikimate 5-dehydrogenase  42.65 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4117  shikimate 5-dehydrogenase  45.22 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1767  shikimate 5-dehydrogenase  44.29 
 
 		 288 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3450  shikimate 5-dehydrogenase  42.86 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1489  shikimate 5-dehydrogenase  45.2 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.06753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0196  shikimate 5-dehydrogenase  42.44 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  43.17 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1489  shikimate 5-dehydrogenase  44.13 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2813  shikimate 5-dehydrogenase  41.96 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4285  shikimate 5-dehydrogenase  43.06 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1254  shikimate 5-dehydrogenase  44.01 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1035  shikimate 5-dehydrogenase  41.87 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1275  shikimate 5-dehydrogenase  42.21 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3613  shikimate 5-dehydrogenase  40.15 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3384  shikimate 5-dehydrogenase  38.69 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2761  shikimate 5-dehydrogenase  40.96 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2830  shikimate dehydrogenase  37.64 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0523448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  35.83 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2840  shikimate 5-dehydrogenase  36.26 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  35.58 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2976  shikimate dehydrogenase  31.25 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  33.98 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  31.65 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  31 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  34.63 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2467  shikimate 5-dehydrogenase  29.93 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502359  hitchhiker  0.0000000000141391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  32.58 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1889  shikimate 5-dehydrogenase  32.75 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0022  shikimate dehydrogenase  33.46 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  31.03 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  31.5 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2504  shikimate dehydrogenase  34.51 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2281  shikimate 5-dehydrogenase  34.07 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.010499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0115  shikimate dehydrogenase  35.53 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  30.88 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0656  shikimate 5-dehydrogenase  38.19 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  33.72 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  28.83 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0743  shikimate 5-dehydrogenase  30.27 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  29.35 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  32.71 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0048  shikimate 5-dehydrogenase  33.09 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0030  shikimate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2226  shikimate 5-dehydrogenase  36.03 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2723  shikimate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0061  shikimate 5-dehydrogenase  35.48 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0253  shikimate 5-dehydrogenase  29.76 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  28.16 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  31.16 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2854  shikimate 5-dehydrogenase  34.3 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5013  shikimate 5-dehydrogenase  35.48 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1552  shikimate 5-dehydrogenase  34.11 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0088  shikimate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  32.72 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  32.08 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3291  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3496  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2494  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.454315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3493  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1274  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0414  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3458  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1171  shikimate 5-dehydrogenase  31.6 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2777  shikimate 5-dehydrogenase  32.14 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.371956 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0454  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1353  shikimate 5-dehydrogenase  34.63 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000636445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2359  shikimate 5-dehydrogenase  34.25 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1971  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  27.3 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.84305  hitchhiker  0.000409791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  35 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0429  shikimate 5-dehydrogenase  33.98 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0689  shikimate 5-dehydrogenase  29.77 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00230  shikimate 5-dehydrogenase  33.69 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1653  shikimate 5-dehydrogenase  27.94 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  29.64 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30051  shikimate 5-dehydrogenase  29.33 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1688  shikimate 5-dehydrogenase  27.94 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.8714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>