186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11488 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11488  serine protease, subtilase family protein  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  38.54 
 
 
818 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.37 
 
 
940 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.57 
 
 
2036 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  41.57 
 
 
1969 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  38.38 
 
 
861 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  43.59 
 
 
1380 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.46 
 
 
1282 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.42 
 
 
835 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.67 
 
 
835 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.69 
 
 
2000 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  38.2 
 
 
2272 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  46.27 
 
 
951 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  43.75 
 
 
951 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  38.16 
 
 
721 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.59 
 
 
2122 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.08 
 
 
1862 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.02 
 
 
1732 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  51.61 
 
 
3295 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.39 
 
 
528 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  47.14 
 
 
1361 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.55 
 
 
971 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  50.98 
 
 
938 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
1158 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  33.64 
 
 
995 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  58.33 
 
 
967 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.94 
 
 
978 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.48 
 
 
930 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.21 
 
 
963 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.38 
 
 
910 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50.79 
 
 
1356 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.48 
 
 
815 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  58.97 
 
 
735 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  51.02 
 
 
1094 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  47.37 
 
 
1565 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.45 
 
 
929 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  39.06 
 
 
2065 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.46 
 
 
1602 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  43.9 
 
 
2554 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  43.08 
 
 
848 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44.59 
 
 
460 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  45 
 
 
408 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 
719 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  38.27 
 
 
1104 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  47.76 
 
 
856 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  44.64 
 
 
960 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  44.64 
 
 
960 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  44.78 
 
 
1830 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.28 
 
 
1095 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  41.07 
 
 
971 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 
699 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.9 
 
 
952 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  37.88 
 
 
769 aa  49.3  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.93 
 
 
1667 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.05 
 
 
1682 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.18 
 
 
1667 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  44.12 
 
 
840 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.28 
 
 
945 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.05 
 
 
1371 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  46.94 
 
 
658 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 
786 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  41.1 
 
 
3197 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 
845 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  50 
 
 
530 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  35.85 
 
 
1606 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  52.27 
 
 
867 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.33 
 
 
1011 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.95 
 
 
2176 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  30 
 
 
1027 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  39.33 
 
 
816 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.74 
 
 
836 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.23 
 
 
1387 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.28 
 
 
802 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  44.44 
 
 
960 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  57.89 
 
 
679 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  48.84 
 
 
869 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.73 
 
 
3197 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  51.06 
 
 
823 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.64 
 
 
1236 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  62.86 
 
 
871 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  38.57 
 
 
1189 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.28 
 
 
870 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  43.1 
 
 
865 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  48.89 
 
 
2552 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  44.26 
 
 
945 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  64.71 
 
 
869 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  55.56 
 
 
971 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  45.45 
 
 
1150 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  55.56 
 
 
1018 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  38.89 
 
 
615 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  33.33 
 
 
1311 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  43.4 
 
 
938 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  36.56 
 
 
943 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  35.05 
 
 
1231 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  30.7 
 
 
1528 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  37.04 
 
 
1104 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  35 
 
 
677 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  50 
 
 
713 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  57.89 
 
 
685 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.83 
 
 
575 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>