109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1901 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  72.15 
 
 		 485 aa  693    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  100 
 
 		 472 aa  968    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  36.45 
 
 		 659 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  39.82 
 
 		 653 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  39.23 
 
 		 646 aa  223  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  32.71 
 
 		 517 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  32.1 
 
 		 669 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  32.07 
 
 		 691 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  34.92 
 
 		 782 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  34.92 
 
 		 782 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  35.55 
 
 		 782 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  31.98 
 
 		 738 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  35.46 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  35.8 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  31.53 
 
 		 747 aa  182  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  34.91 
 
 		 779 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  31.83 
 
 		 680 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  30.74 
 
 		 734 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  31.18 
 
 		 639 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  31.66 
 
 		 759 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  32.48 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  31.74 
 
 		 829 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  29.48 
 
 		 761 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  33.26 
 
 		 782 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  33.8 
 
 		 614 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  30.92 
 
 		 442 aa  160  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  30.58 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  29.16 
 
 		 628 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  28.73 
 
 		 764 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  29.91 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  31.48 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  26.86 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  26.86 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.67 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  26.22 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  27.95 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 1579 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.9 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.46 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  24.09 
 
 		 1557 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  27.14 
 
 		 744 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  27.76 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  42.03 
 
 		 130 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  27.13 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.29 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  27.65 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.98 
 
 		 1536 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  26.2 
 
 		 733 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  27.09 
 
 		 762 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.67 
 
 		 787 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  26.2 
 
 		 733 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  23.47 
 
 		 1093 aa  54.7  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  22.14 
 
 		 740 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  22.69 
 
 		 881 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  25.78 
 
 		 726 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.45 
 
 		 1538 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  33.96 
 
 		 725 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.4 
 
 		 739 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  24.27 
 
 		 998 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  25.87 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.87 
 
 		 526 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  25.46 
 
 		 772 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  25.46 
 
 		 776 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  24.65 
 
 		 722 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  25.06 
 
 		 736 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  21.76 
 
 		 731 aa  50.8  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.31 
 
 		 728 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  32.89 
 
 		 754 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.5 
 
 		 567 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  24.42 
 
 		 742 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  24.04 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.48 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  27.03 
 
 		 768 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  25.3 
 
 		 739 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  24.33 
 
 		 985 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  28.48 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.85 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  30.28 
 
 		 742 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.65 
 
 		 747 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  25.13 
 
 		 736 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  28.06 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.45 
 
 		 1534 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  25.32 
 
 		 735 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  20.84 
 
 		 879 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  28.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  25.06 
 
 		 976 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  25.06 
 
 		 976 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  25.62 
 
 		 1025 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  28.97 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  22.82 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  22.32 
 
 		 738 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  23.97 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  23.13 
 
 		 1000 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  23.13 
 
 		 1000 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  25.18 
 
 		 730 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  24.04 
 
 		 1039 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  25.48 
 
 		 968 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>