223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0861 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  100 
 
 		 782 aa  1565    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  100 
 
 		 782 aa  1565    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  80.51 
 
 		 782 aa  1234    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  99.36 
 
 		 782 aa  1555    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  79.95 
 
 		 779 aa  1259    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  38.78 
 
 		 517 aa  363  8e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  40.96 
 
 		 680 aa  291  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  38.8 
 
 		 445 aa  283  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  39.05 
 
 		 829 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  38.75 
 
 		 734 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  36.51 
 
 		 764 aa  266  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  40.66 
 
 		 438 aa  264  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  36.53 
 
 		 639 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  36.11 
 
 		 738 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  35.28 
 
 		 759 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  34.83 
 
 		 747 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  39.23 
 
 		 431 aa  234  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  37.53 
 
 		 761 aa  231  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  35.68 
 
 		 493 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  33.95 
 
 		 485 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  34.92 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  33.86 
 
 		 614 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  30.22 
 
 		 420 aa  169  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  32.41 
 
 		 669 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  30.8 
 
 		 435 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  31.44 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.91 
 
 		 659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  27.87 
 
 		 447 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  31.36 
 
 		 646 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  27.87 
 
 		 447 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.29 
 
 		 438 aa  146  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  28.7 
 
 		 439 aa  145  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 		 445 aa  144  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  33.85 
 
 		 661 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  29.14 
 
 		 691 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  28.03 
 
 		 422 aa  126  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  48.11 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.97 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 		 1579 aa  80.9  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.9 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  27.74 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.74 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  24.57 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  25.4 
 
 		 738 aa  74.7  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  27.49 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  24.67 
 
 		 738 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  25.37 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  26.65 
 
 		 368 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  24.43 
 
 		 731 aa  72  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  26.54 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  28.44 
 
 		 1034 aa  71.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  29.66 
 
 		 952 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  25.55 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  26.19 
 
 		 768 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  24.44 
 
 		 740 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.38 
 
 		 976 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.38 
 
 		 976 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  26.65 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  29.31 
 
 		 952 aa  68.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  27.59 
 
 		 744 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  23.55 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  26.91 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.58 
 
 		 410 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  26.16 
 
 		 365 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  26.41 
 
 		 365 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  23.75 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.82 
 
 		 728 aa  66.6  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  25.92 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  24.77 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  26.51 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  27.35 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  27.47 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  28.43 
 
 		 968 aa  65.1  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  28.47 
 
 		 985 aa  64.7  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.1 
 
 		 1000 aa  64.3  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.1 
 
 		 1000 aa  64.3  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.7 
 
 		 825 aa  64.3  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  25.4 
 
 		 747 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  24.28 
 
 		 728 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  26.73 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  28.12 
 
 		 998 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  25.65 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  26.12 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  62  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.51 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.38 
 
 		 744 aa  62  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  23.98 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  28.22 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  24.55 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  28 
 
 		 745 aa  60.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  26.79 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  25.33 
 
 		 363 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  27.07 
 
 		 762 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  25.34 
 
 		 735 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.64 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  23.06 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  25.36 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  24.82 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>