204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5152 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  79.95 
 
 		 782 aa  1244    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  79.95 
 
 		 782 aa  1244    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  85.93 
 
 		 782 aa  1321    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  80.08 
 
 		 782 aa  1244    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  100 
 
 		 779 aa  1562    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  38.57 
 
 		 517 aa  364  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  40.05 
 
 		 680 aa  296  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  39.49 
 
 		 445 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  38.29 
 
 		 829 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  41.43 
 
 		 438 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  37 
 
 		 639 aa  270  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  34.95 
 
 		 764 aa  260  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  37.96 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  34.38 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  35 
 
 		 738 aa  250  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  35.51 
 
 		 759 aa  247  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  39.95 
 
 		 431 aa  234  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  35.43 
 
 		 761 aa  225  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  35.52 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  36.57 
 
 		 614 aa  194  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  33.89 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  34.91 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  33.54 
 
 		 669 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  29.74 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  31.42 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.64 
 
 		 447 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.64 
 
 		 447 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  31.85 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.68 
 
 		 659 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.16 
 
 		 438 aa  147  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.58 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  29.65 
 
 		 646 aa  145  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  26.48 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  31.11 
 
 		 661 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  29.14 
 
 		 691 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  28.61 
 
 		 422 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  44.86 
 
 		 130 aa  108  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  29.35 
 
 		 653 aa  104  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  27.23 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  27.23 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  27.58 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  26.73 
 
 		 365 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  27.23 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 1579 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  24.72 
 
 		 738 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  27.07 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.97 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  27.03 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.75 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  27.59 
 
 		 1034 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  25.92 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.84 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  27.74 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  28.85 
 
 		 952 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.91 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.21 
 
 		 740 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  27 
 
 		 982 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  24.49 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  28.33 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  26.21 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.85 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.18 
 
 		 976 aa  64.3  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  26.29 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.18 
 
 		 976 aa  64.3  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.46 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  24.25 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  27.03 
 
 		 1039 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  27.23 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  25.55 
 
 		 659 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  23.84 
 
 		 813 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  26.41 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  25.35 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  24.52 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  27.51 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  26.41 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  27.38 
 
 		 1000 aa  62.4  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  27.38 
 
 		 1000 aa  62.4  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  25.91 
 
 		 736 aa  62  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  23.45 
 
 		 728 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.84 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  24.89 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  25.93 
 
 		 363 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  26.79 
 
 		 968 aa  60.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  25.13 
 
 		 373 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  23.96 
 
 		 742 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  25.91 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  24.21 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  24.46 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  31.61 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.67 
 
 		 1356 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  25.06 
 
 		 733 aa  58.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  25.12 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  24.65 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.87 
 
 		 985 aa  57.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  24.51 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  26.65 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  23.36 
 
 		 834 aa  57.8  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.09 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.4 
 
 		 731 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  24.82 
 
 		 375 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>