66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02480 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  100 
 
 		 691 aa  1431    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  40.99 
 
 		 669 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  40.15 
 
 		 661 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  32.07 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.81 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.88 
 
 		 659 aa  187  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  30.27 
 
 		 646 aa  180  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.25 
 
 		 653 aa  178  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  30.77 
 
 		 829 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  30.4 
 
 		 639 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  30.23 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  28.46 
 
 		 734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.91 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  27.94 
 
 		 759 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 		 680 aa  163  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  26.85 
 
 		 747 aa  160  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  33.41 
 
 		 431 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  27.68 
 
 		 764 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  27.82 
 
 		 761 aa  144  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  29.27 
 
 		 628 aa  143  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  27.11 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  29.35 
 
 		 782 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  29.35 
 
 		 782 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  29.35 
 
 		 782 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  29.14 
 
 		 779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  26.46 
 
 		 738 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  26.46 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  29.21 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  25.99 
 
 		 439 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  28.01 
 
 		 782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  26.52 
 
 		 447 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  26.52 
 
 		 447 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  26.77 
 
 		 422 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  26.6 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  26.99 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 		 493 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  24.54 
 
 		 1579 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  47.06 
 
 		 130 aa  65.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  50.82 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  43.24 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  41.1 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  40.68 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  30.53 
 
 		 487 aa  52  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  38.98 
 
 		 221 aa  50.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  26.18 
 
 		 745 aa  50.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  53.49 
 
 		 215 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  42.37 
 
 		 376 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  52.5 
 
 		 201 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  47.62 
 
 		 201 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  53.85 
 
 		 201 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.26 
 
 		 833 aa  47.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  43.48 
 
 		 463 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  40.38 
 
 		 251 aa  47.4  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  42.86 
 
 		 212 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  43.64 
 
 		 245 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.61 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  33.77 
 
 		 206 aa  45.8  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.86 
 
 		 731 aa  45.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  23.16 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.05 
 
 		 731 aa  44.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  48.72 
 
 		 209 aa  44.3  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  25.78 
 
 		 1214 aa  44.3  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  37.68 
 
 		 776 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>