102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1611 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  100 
 
 		 653 aa  1342    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  93.87 
 
 		 646 aa  1226    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  64.38 
 
 		 659 aa  852    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  37.78 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  35.93 
 
 		 669 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  39.82 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  33.76 
 
 		 661 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.74 
 
 		 691 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  30.19 
 
 		 639 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  31.22 
 
 		 747 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  31.55 
 
 		 829 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  30.64 
 
 		 759 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  29.72 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  30.74 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  30.21 
 
 		 764 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  29.56 
 
 		 761 aa  152  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  30.21 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  28.54 
 
 		 445 aa  151  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  28.88 
 
 		 628 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  27.42 
 
 		 680 aa  150  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  29.22 
 
 		 614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.17 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  31.24 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  31.24 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.17 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  30 
 
 		 779 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  29.63 
 
 		 442 aa  140  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  28.23 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.47 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.53 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  25.68 
 
 		 420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  31.67 
 
 		 445 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  31.29 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  31.82 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  28.96 
 
 		 782 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  26.52 
 
 		 422 aa  99  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  27.24 
 
 		 438 aa  90.9  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  53.45 
 
 		 130 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  26.15 
 
 		 998 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  31.03 
 
 		 744 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  25.32 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  26.89 
 
 		 976 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  26.89 
 
 		 976 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  26.21 
 
 		 968 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  24.92 
 
 		 1107 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  27.27 
 
 		 982 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.87 
 
 		 985 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  26.69 
 
 		 1039 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  25 
 
 		 710 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.71 
 
 		 563 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  24.72 
 
 		 742 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.82 
 
 		 795 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  27.21 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.66 
 
 		 573 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  29.27 
 
 		 746 aa  51.2  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  23.76 
 
 		 907 aa  51.2  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  22.38 
 
 		 1579 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.27 
 
 		 573 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  26.71 
 
 		 754 aa  50.4  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  27.44 
 
 		 1000 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  27.44 
 
 		 1000 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  26.06 
 
 		 1034 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  29.49 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.67 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24.61 
 
 		 736 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  28.97 
 
 		 739 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.29 
 
 		 567 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.62 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  28.39 
 
 		 762 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.68 
 
 		 526 aa  47.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  22.77 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  29.41 
 
 		 740 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  25.13 
 
 		 728 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  25.96 
 
 		 737 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.84 
 
 		 1098 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  24.38 
 
 		 998 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  26.22 
 
 		 742 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  29.68 
 
 		 678 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  27.51 
 
 		 471 aa  45.8  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  28.38 
 
 		 745 aa  45.8  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  25.48 
 
 		 267 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  25.79 
 
 		 1006 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  24.93 
 
 		 974 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  22.51 
 
 		 731 aa  45.8  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  25.67 
 
 		 744 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  30.41 
 
 		 727 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  25.67 
 
 		 750 aa  45.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  24.86 
 
 		 739 aa  45.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.84 
 
 		 742 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  29.63 
 
 		 728 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  26.27 
 
 		 814 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  24.2 
 
 		 1102 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  26.23 
 
 		 728 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  26.85 
 
 		 1093 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  26.47 
 
 		 497 aa  44.7  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  25.59 
 
 		 952 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  24.68 
 
 		 1100 aa  44.3  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  25.08 
 
 		 952 aa  43.9  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  26.73 
 
 		 1034 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>