39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0744 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  273  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  92.91 
 
 		 445 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  46.43 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  48.11 
 
 		 782 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  47.66 
 
 		 782 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  48.11 
 
 		 782 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  48.11 
 
 		 782 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  44.86 
 
 		 779 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  46.32 
 
 		 680 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  40.34 
 
 		 764 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  41.96 
 
 		 517 aa  100  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  43.36 
 
 		 438 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  41.88 
 
 		 829 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  39.17 
 
 		 734 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  45.63 
 
 		 493 aa  94.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  35.51 
 
 		 759 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  38.53 
 
 		 747 aa  84  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  37.5 
 
 		 738 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 435 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  35.29 
 
 		 761 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  57.38 
 
 		 659 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  34.17 
 
 		 614 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  38.46 
 
 		 639 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  46.58 
 
 		 661 aa  68.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  53.45 
 
 		 646 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  53.45 
 
 		 653 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  55.77 
 
 		 669 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  47.06 
 
 		 691 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  43.66 
 
 		 628 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  39.33 
 
 		 438 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  42.03 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  33.61 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  40 
 
 		 485 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  34.83 
 
 		 439 aa  50.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  46 
 
 		 447 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  46 
 
 		 447 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  41.82 
 
 		 1579 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  33.85 
 
 		 442 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>