122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0573 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  881    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  57.67 
 
 		 438 aa  508  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  53.35 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  48.97 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  49.39 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  44.99 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  42.14 
 
 		 447 aa  326  5e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  42.14 
 
 		 447 aa  326  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  34.93 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  34.37 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 680 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  29.68 
 
 		 761 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  32.03 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  32.24 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  29.61 
 
 		 734 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  32.48 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  31.31 
 
 		 747 aa  173  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  30.27 
 
 		 782 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  31.07 
 
 		 738 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  31.06 
 
 		 759 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  31.42 
 
 		 779 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  31.5 
 
 		 829 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  31.28 
 
 		 764 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  31.49 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  30.26 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  30.8 
 
 		 782 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  30.8 
 
 		 782 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  30.8 
 
 		 782 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  29.64 
 
 		 639 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.28 
 
 		 614 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  30.93 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.49 
 
 		 659 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  28.02 
 
 		 493 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.95 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.94 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  27.71 
 
 		 628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  26.1 
 
 		 661 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  29.21 
 
 		 653 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  50.52 
 
 		 100 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  75.5  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  24.01 
 
 		 968 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  23.7 
 
 		 976 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  23.7 
 
 		 976 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  23.21 
 
 		 750 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  26.91 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.73 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  25.53 
 
 		 998 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  23.7 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  24.07 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  23.71 
 
 		 754 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.8 
 
 		 738 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.4 
 
 		 567 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  24.57 
 
 		 728 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  23.33 
 
 		 736 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  25.68 
 
 		 881 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  31.18 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  23.12 
 
 		 741 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 1579 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.99 
 
 		 526 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.54 
 
 		 698 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 1000 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 1000 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  22.84 
 
 		 982 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  29.93 
 
 		 744 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  22.37 
 
 		 742 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  22.36 
 
 		 742 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  24.81 
 
 		 727 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  23.79 
 
 		 750 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  25.89 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  25.89 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  32.87 
 
 		 726 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  30.92 
 
 		 698 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  23.66 
 
 		 985 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.38 
 
 		 879 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  25.53 
 
 		 731 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.26 
 
 		 744 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  23.28 
 
 		 641 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  23.88 
 
 		 1006 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.98 
 
 		 795 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.2 
 
 		 740 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  29.71 
 
 		 736 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  22.3 
 
 		 1039 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  25.33 
 
 		 728 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  23.48 
 
 		 741 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  24.38 
 
 		 731 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  20.9 
 
 		 735 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  25.47 
 
 		 744 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  29.53 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  24.55 
 
 		 731 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.71 
 
 		 530 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.4 
 
 		 732 aa  46.6  0.0008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  29.77 
 
 		 741 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  24.04 
 
 		 740 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.8 
 
 		 742 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  21.99 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  27.01 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  23.27 
 
 		 742 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  28.8 
 
 		 762 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.14 
 
 		 711 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  30.08 
 
 		 749 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>