68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0969 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  900    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  900    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  54.44 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  45.33 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  45.02 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  43.58 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  43.28 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  40.41 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  39.52 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  33.25 
 
 		 829 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  29.98 
 
 		 747 aa  163  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  30.22 
 
 		 734 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  29.13 
 
 		 614 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  29.52 
 
 		 659 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  31.78 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  28.64 
 
 		 779 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.12 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  28.79 
 
 		 764 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  29.47 
 
 		 759 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  27.87 
 
 		 782 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  27.63 
 
 		 782 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  27.87 
 
 		 782 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.89 
 
 		 646 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  28.17 
 
 		 653 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  29.4 
 
 		 639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  30.02 
 
 		 738 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  26.99 
 
 		 782 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  27.13 
 
 		 761 aa  146  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  27.12 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  26.22 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  29.27 
 
 		 669 aa  142  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  25.35 
 
 		 431 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.84 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  26.83 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 		 493 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.29 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  56.84 
 
 		 100 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  25.33 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  21.92 
 
 		 710 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 1579 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  46 
 
 		 130 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1191  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  21.29 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  23.44 
 
 		 727 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.99 
 
 		 732 aa  48.9  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  22.33 
 
 		 730 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  26.4 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  22.06 
 
 		 907 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  27.89 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  30.33 
 
 		 710 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  21.18 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.26 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  26.95 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  30.36 
 
 		 732 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  20.69 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  21.5 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  23.27 
 
 		 881 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  31.82 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  26.43 
 
 		 724 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  21.23 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  31.82 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  28.33 
 
 		 740 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  32.79 
 
 		 792 aa  43.5  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  19.46 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  21.08 
 
 		 902 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.26 
 
 		 742 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>