124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0999 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  100 
 
 		 759 aa  1558    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  48.53 
 
 		 747 aa  703    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  42.46 
 
 		 761 aa  591  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  41.08 
 
 		 764 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  37.09 
 
 		 734 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  35.71 
 
 		 738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  42.83 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  38.87 
 
 		 639 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  42.73 
 
 		 680 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  38.41 
 
 		 445 aa  296  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  39.39 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  35.99 
 
 		 438 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  35.7 
 
 		 431 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  35.51 
 
 		 779 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  36.32 
 
 		 493 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  35.28 
 
 		 782 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  35.28 
 
 		 782 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  35.28 
 
 		 782 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  35.45 
 
 		 782 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  31.29 
 
 		 669 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  30.24 
 
 		 614 aa  178  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  31.66 
 
 		 472 aa  177  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.7 
 
 		 485 aa  177  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  29.81 
 
 		 646 aa  171  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  31.3 
 
 		 659 aa  170  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  31.06 
 
 		 435 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  28.14 
 
 		 691 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  28.15 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  29.02 
 
 		 439 aa  158  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.38 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.54 
 
 		 447 aa  152  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.54 
 
 		 447 aa  152  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 445 aa  151  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  29.27 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  29.82 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.13 
 
 		 628 aa  138  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  27.88 
 
 		 661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.3 
 
 		 653 aa  124  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  35.51 
 
 		 130 aa  86.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  24.45 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  23.41 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  21.04 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  23.7 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.37 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  30.91 
 
 		 474 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  21.53 
 
 		 998 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  24.62 
 
 		 746 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.65 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.57 
 
 		 375 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  24.75 
 
 		 376 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  20.98 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.92 
 
 		 732 aa  55.5  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  25.59 
 
 		 745 aa  54.7  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  23.28 
 
 		 747 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  29.05 
 
 		 375 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  23.17 
 
 		 879 aa  53.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  28.08 
 
 		 373 aa  53.5  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1579 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.23 
 
 		 718 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  25.32 
 
 		 369 aa  52  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  28.08 
 
 		 373 aa  52  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  24.52 
 
 		 730 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.25 
 
 		 563 aa  51.6  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  21.18 
 
 		 982 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  28.08 
 
 		 373 aa  51.6  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.11 
 
 		 526 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  20.24 
 
 		 1356 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  22.63 
 
 		 1000 aa  51.2  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  22.63 
 
 		 1000 aa  51.2  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 365 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  28.92 
 
 		 363 aa  50.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 365 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  23.06 
 
 		 768 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  28.24 
 
 		 365 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  28.98 
 
 		 678 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24.26 
 
 		 567 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  21.03 
 
 		 968 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  21.4 
 
 		 985 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  21.71 
 
 		 688 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  23.3 
 
 		 742 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  20.46 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  28.57 
 
 		 375 aa  49.3  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  29.49 
 
 		 469 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  29.94 
 
 		 375 aa  48.9  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  24.19 
 
 		 806 aa  47.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  23.37 
 
 		 727 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  21.45 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  24.44 
 
 		 573 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.63 
 
 		 475 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  23.2 
 
 		 741 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  20.87 
 
 		 1039 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  19.91 
 
 		 1107 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.46 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  22.74 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1406  hypothetical protein  25.42 
 
 		 353 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000364986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  29.56 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.99 
 
 		 728 aa  45.8  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>