146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0435 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  100 
 
 		 639 aa  1305    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  40.93 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  42.09 
 
 		 764 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  42.41 
 
 		 829 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  39.34 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  40.22 
 
 		 747 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  38.87 
 
 		 759 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  38.7 
 
 		 761 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  41.51 
 
 		 517 aa  326  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  39.77 
 
 		 680 aa  323  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  38.28 
 
 		 438 aa  284  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  37 
 
 		 779 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  37.04 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  36.77 
 
 		 782 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  36.15 
 
 		 782 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  36.53 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  36.53 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  35.17 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 		 493 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  31.18 
 
 		 472 aa  178  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  30.19 
 
 		 653 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  30.27 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  31.25 
 
 		 669 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  29.46 
 
 		 659 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  29.65 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  29.84 
 
 		 485 aa  170  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.3 
 
 		 691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  30.32 
 
 		 438 aa  160  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 		 435 aa  153  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  28.92 
 
 		 422 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.84 
 
 		 439 aa  146  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.94 
 
 		 447 aa  144  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.94 
 
 		 447 aa  144  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  32.05 
 
 		 661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  29.18 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  28.61 
 
 		 420 aa  134  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  27.93 
 
 		 628 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  38.46 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  24.51 
 
 		 1000 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  24.51 
 
 		 1000 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 952 aa  64.3  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  24.87 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.5 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  25.06 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  24.71 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.36 
 
 		 738 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  22.77 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  24.18 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  22.74 
 
 		 998 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  22.49 
 
 		 985 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  23.62 
 
 		 968 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.11 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  24.45 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  23.19 
 
 		 1034 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.88 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  25.6 
 
 		 742 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  23.93 
 
 		 982 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  25.48 
 
 		 740 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  24.13 
 
 		 725 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.67 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  23.29 
 
 		 747 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  24.35 
 
 		 742 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 		 728 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  32.65 
 
 		 375 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.06 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  23.54 
 
 		 738 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  23.26 
 
 		 1034 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.34 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  24.29 
 
 		 373 aa  54.3  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  25.43 
 
 		 746 aa  54.3  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  30.33 
 
 		 750 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  24.29 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.21 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  20.79 
 
 		 814 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  32.65 
 
 		 375 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  22.93 
 
 		 1006 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  24.38 
 
 		 754 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  23.87 
 
 		 976 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  23.87 
 
 		 976 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  26.16 
 
 		 902 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  25.18 
 
 		 907 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.62 
 
 		 574 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.61 
 
 		 735 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  29.61 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  24.33 
 
 		 1123 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  24.09 
 
 		 373 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  24.23 
 
 		 736 aa  51.2  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  23.65 
 
 		 368 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.43 
 
 		 530 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  29.65 
 
 		 573 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  22.25 
 
 		 1100 aa  50.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  23.5 
 
 		 736 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.67 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.77 
 
 		 526 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  22.6 
 
 		 1039 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  31.97 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  30.5 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.93 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.57 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>