72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02830 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  100 
 
 		 669 aa  1379    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  51.44 
 
 		 661 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  40.99 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  37.31 
 
 		 659 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  34.65 
 
 		 646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  34.4 
 
 		 653 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  32.1 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  31.09 
 
 		 747 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  31.29 
 
 		 759 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  30.09 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  33.54 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  31.85 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  31.75 
 
 		 517 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  31.25 
 
 		 639 aa  174  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  29.87 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  32.41 
 
 		 782 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  32.41 
 
 		 782 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  32.41 
 
 		 782 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  28.45 
 
 		 445 aa  160  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  30.22 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  32.06 
 
 		 782 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  31.5 
 
 		 431 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  28.98 
 
 		 442 aa  157  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 		 435 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  28.72 
 
 		 761 aa  155  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  27.95 
 
 		 829 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  28.21 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  30.35 
 
 		 628 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  27.59 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 		 493 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  32.83 
 
 		 680 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  28.6 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  28.6 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.66 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  28.89 
 
 		 614 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  27.08 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  28.39 
 
 		 438 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  55.77 
 
 		 130 aa  65.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  29.21 
 
 		 745 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  27.01 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.02 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  48.28 
 
 		 100 aa  53.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  28.64 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  23.02 
 
 		 728 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  29.81 
 
 		 881 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.82 
 
 		 744 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  26.11 
 
 		 738 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  26.2 
 
 		 686 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  22.12 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  47.27 
 
 		 1579 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.56 
 
 		 762 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  30.85 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  23.9 
 
 		 768 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  29.17 
 
 		 879 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  25.58 
 
 		 952 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  28.94 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.66 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.53 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  27.91 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.22 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  26.57 
 
 		 739 aa  45.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  32.61 
 
 		 372 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  23.92 
 
 		 659 aa  44.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  23.94 
 
 		 952 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  29.45 
 
 		 810 aa  44.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  29 
 
 		 474 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  27.37 
 
 		 746 aa  44.3  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  27.13 
 
 		 740 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  28.93 
 
 		 1214 aa  43.9  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.67 
 
 		 741 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  28 
 
 		 475 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>