91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1560 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  100 
 
 		 659 aa  1348    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  64.15 
 
 		 646 aa  849    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  62.74 
 
 		 653 aa  843    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  36.45 
 
 		 472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  37.74 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  37.31 
 
 		 669 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  32.24 
 
 		 661 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.88 
 
 		 691 aa  187  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  32.51 
 
 		 738 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  29.81 
 
 		 517 aa  179  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  32.3 
 
 		 829 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  30.53 
 
 		 747 aa  174  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  29.46 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  30.35 
 
 		 628 aa  171  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  31.3 
 
 		 759 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  31.4 
 
 		 764 aa  167  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  32.66 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.93 
 
 		 438 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.69 
 
 		 614 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  30.43 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 680 aa  158  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  30.1 
 
 		 734 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  30.36 
 
 		 431 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  30.91 
 
 		 782 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  30.68 
 
 		 779 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  30.91 
 
 		 782 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  30.91 
 
 		 782 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 445 aa  147  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  30.09 
 
 		 442 aa  144  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  30.49 
 
 		 435 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.28 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  28.34 
 
 		 420 aa  127  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  28.67 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 		 493 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  28.76 
 
 		 422 aa  114  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  29.33 
 
 		 782 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  57.38 
 
 		 130 aa  73.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  32.9 
 
 		 744 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  24.54 
 
 		 998 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  25.15 
 
 		 1034 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  30.39 
 
 		 725 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  30.77 
 
 		 746 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  30.13 
 
 		 741 aa  54.3  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  30.13 
 
 		 762 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.54 
 
 		 738 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  29.49 
 
 		 742 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  25.94 
 
 		 985 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  29.7 
 
 		 742 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  25.3 
 
 		 710 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  26.52 
 
 		 1039 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  23.91 
 
 		 471 aa  50.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  25.11 
 
 		 998 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  30.32 
 
 		 736 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  29.68 
 
 		 739 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  33.56 
 
 		 750 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  24.14 
 
 		 907 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  27.91 
 
 		 1034 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  26.27 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  30.52 
 
 		 678 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.93 
 
 		 526 aa  48.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.68 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.44 
 
 		 573 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  23.16 
 
 		 968 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  31.13 
 
 		 737 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.12 
 
 		 563 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  29.45 
 
 		 740 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  25.11 
 
 		 1100 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  27.22 
 
 		 814 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  24.34 
 
 		 754 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  28.76 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.44 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  32.37 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.37 
 
 		 1098 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  24.54 
 
 		 952 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  26.93 
 
 		 982 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  31.79 
 
 		 727 aa  45.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  23.33 
 
 		 952 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  27.49 
 
 		 754 aa  45.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 1579 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  29.8 
 
 		 733 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.94 
 
 		 766 aa  44.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  26.27 
 
 		 1000 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  26.27 
 
 		 1000 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  22.27 
 
 		 475 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  30.87 
 
 		 744 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  27.92 
 
 		 750 aa  44.3  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  31.13 
 
 		 733 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  23.19 
 
 		 806 aa  43.9  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  24.4 
 
 		 488 aa  43.9  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>