138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1856 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  100 
 
 		 438 aa  895    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  70.16 
 
 		 439 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  57.67 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  47.18 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  45.16 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  45.33 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  45.33 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  46.52 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  38.57 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  31.42 
 
 		 747 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  29.98 
 
 		 761 aa  166  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  28.23 
 
 		 734 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  33 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  31.31 
 
 		 764 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  30.23 
 
 		 829 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  31.11 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  30.32 
 
 		 639 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.22 
 
 		 485 aa  159  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.8 
 
 		 614 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  27.49 
 
 		 738 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  29.38 
 
 		 759 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  28.43 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  28.7 
 
 		 782 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.36 
 
 		 680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  29.16 
 
 		 779 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  29.29 
 
 		 782 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  29.29 
 
 		 782 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  29.06 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  29.67 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  30.33 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  27.29 
 
 		 691 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  29.28 
 
 		 659 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  26.37 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  28.39 
 
 		 669 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  47.42 
 
 		 100 aa  101  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  25.35 
 
 		 661 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  27.24 
 
 		 653 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  27.24 
 
 		 646 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  24.94 
 
 		 742 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  24.28 
 
 		 698 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  28.22 
 
 		 628 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  23.8 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.06 
 
 		 728 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  23.76 
 
 		 902 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  25.41 
 
 		 750 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  39.33 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.82 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  23.23 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  25.53 
 
 		 976 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  25.53 
 
 		 976 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  25.24 
 
 		 1000 aa  57.4  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  25.24 
 
 		 1000 aa  57.4  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  24.78 
 
 		 914 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  25.52 
 
 		 813 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  24.48 
 
 		 952 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  31.94 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  28.48 
 
 		 567 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  31.94 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  31.94 
 
 		 727 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  27.88 
 
 		 728 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  25.88 
 
 		 727 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  25.75 
 
 		 968 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.19 
 
 		 732 aa  53.9  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  32.8 
 
 		 744 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  22.97 
 
 		 740 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  25.85 
 
 		 728 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  31.29 
 
 		 688 aa  53.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.88 
 
 		 744 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  27.08 
 
 		 998 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.25 
 
 		 731 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  24.55 
 
 		 952 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  23.88 
 
 		 641 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  31.29 
 
 		 726 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  24.62 
 
 		 982 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  24.06 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.99 
 
 		 733 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  30.08 
 
 		 728 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  27.1 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  21.76 
 
 		 1175 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  32.31 
 
 		 731 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  22.41 
 
 		 711 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  24.02 
 
 		 737 aa  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  21.39 
 
 		 944 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  25.58 
 
 		 730 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 1579 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  25.88 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  28.65 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  25.77 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  23.25 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  25 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  21.7 
 
 		 710 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  25 
 
 		 907 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  25.3 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.01 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  32.28 
 
 		 746 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  29.77 
 
 		 736 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  21.08 
 
 		 945 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  29.95 
 
 		 574 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  22.6 
 
 		 739 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  31.25 
 
 		 731 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>