More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1706 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  100 
 
 		 730 aa  1483    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  35.95 
 
 		 710 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  36.89 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  31.89 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  31.89 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  31.89 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.18 
 
 		 721 aa  291  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  29.8 
 
 		 747 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  28.68 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  29.5 
 
 		 710 aa  228  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  31.01 
 
 		 731 aa  227  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  31.16 
 
 		 731 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.74 
 
 		 747 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  31.41 
 
 		 728 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  29.22 
 
 		 749 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  30.73 
 
 		 733 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  30.58 
 
 		 733 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  29.62 
 
 		 762 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  30.03 
 
 		 750 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  31.4 
 
 		 727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  29.92 
 
 		 738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  29.6 
 
 		 722 aa  214  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 724 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  30.41 
 
 		 733 aa  211  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  30.51 
 
 		 740 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  29.95 
 
 		 735 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  30.03 
 
 		 741 aa  208  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  29.37 
 
 		 737 aa  208  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  31.2 
 
 		 719 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  29.94 
 
 		 742 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  29.14 
 
 		 739 aa  204  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  30.38 
 
 		 735 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  28.67 
 
 		 741 aa  204  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  31.14 
 
 		 719 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  30.76 
 
 		 724 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.66 
 
 		 825 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  30.25 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  31.07 
 
 		 736 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  30.04 
 
 		 744 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  28.08 
 
 		 740 aa  200  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  28.64 
 
 		 728 aa  200  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  28.36 
 
 		 727 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  29.97 
 
 		 746 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  28.59 
 
 		 731 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  31.24 
 
 		 736 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  31.1 
 
 		 786 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.65 
 
 		 746 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  30.36 
 
 		 768 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  27.71 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  28.21 
 
 		 778 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  29.54 
 
 		 738 aa  194  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  31.34 
 
 		 725 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  30.65 
 
 		 749 aa  194  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  28.94 
 
 		 711 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.06 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  27.9 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  27.9 
 
 		 778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  28.66 
 
 		 742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.9 
 
 		 778 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  30.62 
 
 		 726 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.9 
 
 		 778 aa  191  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  27.9 
 
 		 778 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.97 
 
 		 728 aa  190  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  27.9 
 
 		 778 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  27.9 
 
 		 778 aa  190  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  28.94 
 
 		 736 aa  190  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  27.9 
 
 		 770 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  30.53 
 
 		 744 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  30.89 
 
 		 720 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  30.23 
 
 		 731 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  27.04 
 
 		 772 aa  187  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  27.81 
 
 		 744 aa  187  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.58 
 
 		 744 aa  187  8e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  28.92 
 
 		 738 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  29 
 
 		 750 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  27.46 
 
 		 744 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  28.55 
 
 		 740 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  30.43 
 
 		 739 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  29.51 
 
 		 740 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  30.58 
 
 		 754 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  29.54 
 
 		 742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  29.77 
 
 		 732 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  31.98 
 
 		 715 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  29.39 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  29.28 
 
 		 784 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  27.79 
 
 		 810 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  30.03 
 
 		 698 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  25.67 
 
 		 792 aa  180  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  27.23 
 
 		 806 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  28.82 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  29.43 
 
 		 728 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.6 
 
 		 698 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  28.14 
 
 		 688 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  28.68 
 
 		 728 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  28.61 
 
 		 772 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.43 
 
 		 742 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  27.94 
 
 		 719 aa  172  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.68 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  29.04 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  29.22 
 
 		 728 aa  168  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>