101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2047 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2047  helicase, putative  100 
 
 
761 aa  1571    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  43.39 
 
 
747 aa  613  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  42.72 
 
 
759 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  38.53 
 
 
764 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  40.11 
 
 
734 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  34.45 
 
 
738 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  41.58 
 
 
829 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  38.84 
 
 
639 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  43.85 
 
 
680 aa  343  7e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  37.23 
 
 
517 aa  281  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  38.68 
 
 
438 aa  277  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  37.14 
 
 
445 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  36.86 
 
 
431 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  37.53 
 
 
782 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  37.53 
 
 
782 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  37.53 
 
 
782 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  36.76 
 
 
493 aa  226  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  35.43 
 
 
779 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  34.68 
 
 
782 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  29.68 
 
 
435 aa  181  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.52 
 
 
485 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  27.77 
 
 
439 aa  170  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  29.48 
 
 
472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.12 
 
 
614 aa  168  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.98 
 
 
438 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  29.87 
 
 
442 aa  165  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.43 
 
 
659 aa  159  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  28.72 
 
 
669 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  31.19 
 
 
422 aa  153  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  27.2 
 
 
420 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.76 
 
 
646 aa  147  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 
445 aa  146  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  27.82 
 
 
691 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  27.13 
 
 
447 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  27.13 
 
 
447 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  31.27 
 
 
653 aa  114  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.77045 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  27.2 
 
 
661 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.33 
 
 
628 aa  90.9  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  75.1  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  23.11 
 
 
1579 aa  64.3  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  23.17 
 
 
881 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  23.15 
 
 
879 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  31.19 
 
 
375 aa  57.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  32.22 
 
 
678 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  30.72 
 
 
469 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.37 
 
 
475 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  31.93 
 
 
474 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  33.13 
 
 
375 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  33.56 
 
 
376 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  30.66 
 
 
373 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  22.17 
 
 
1034 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  22.84 
 
 
998 aa  52  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  31.22 
 
 
373 aa  51.6  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  31.48 
 
 
375 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  30.67 
 
 
365 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  31.22 
 
 
373 aa  51.2  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  30.77 
 
 
365 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  22.44 
 
 
1000 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  22.44 
 
 
1000 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  31.17 
 
 
365 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  30.67 
 
 
365 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  36.49 
 
 
369 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  22.48 
 
 
952 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  22.97 
 
 
952 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  21.62 
 
 
1174 aa  50.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  31.54 
 
 
375 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  21.84 
 
 
1039 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  32.1 
 
 
363 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.17 
 
 
526 aa  48.5  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  21.9 
 
 
985 aa  48.5  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.58 
 
 
719 aa  47.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  23.44 
 
 
530 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.32 
 
 
732 aa  47  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.44 
 
 
1245 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25 
 
 
795 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  22.25 
 
 
872 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  21.73 
 
 
982 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  24.42 
 
 
742 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.32 
 
 
659 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  20.95 
 
 
998 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 
731 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.69 
 
 
705 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  30.13 
 
 
369 aa  45.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  27.36 
 
 
1214 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  42.31 
 
 
100 aa  45.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  25.06 
 
 
1184 aa  45.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.03 
 
 
748 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  33.11 
 
 
369 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  20.89 
 
 
974 aa  45.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  31.08 
 
 
369 aa  45.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  21.79 
 
 
976 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  21.79 
 
 
976 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  25 
 
 
637 aa  45.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  22.41 
 
 
968 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  32.72 
 
 
363 aa  44.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.69 
 
 
705 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.69 
 
 
705 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  26.29 
 
 
754 aa  44.3  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.69 
 
 
705 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.7 
 
 
705 aa  43.9  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>