227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10593 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  100 
 
 		 476 aa  985    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  60.76 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  55.49 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  43.1 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  45.02 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  42.14 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  44.19 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  41.46 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  33.47 
 
 		 924 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  33.47 
 
 		 924 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  35.76 
 
 		 754 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  32.93 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  31.08 
 
 		 678 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  25.92 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  26.13 
 
 		 373 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  26.83 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  27.02 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  25.38 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  26.74 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  25.22 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  25.59 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  26.86 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  26.2 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  25.5 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  25.83 
 
 		 365 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  25.32 
 
 		 369 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  25.71 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  26.13 
 
 		 373 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  25.6 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  26.13 
 
 		 373 aa  97.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  25.28 
 
 		 365 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  24.84 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  24.62 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  25.56 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  25.33 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  24.72 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  25.6 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  24.68 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  25.37 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  24.68 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  29.63 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  26.71 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  32.67 
 
 		 742 aa  80.5  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  34.05 
 
 		 726 aa  80.1  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  32.35 
 
 		 744 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  31.68 
 
 		 750 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  31.32 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  35.16 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  30.29 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  30.34 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  31.75 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  35.64 
 
 		 749 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  31.63 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  24.65 
 
 		 740 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  32.96 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  31.64 
 
 		 768 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  32.97 
 
 		 737 aa  73.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 738 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  35.68 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  32.84 
 
 		 742 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  31.84 
 
 		 720 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  27.61 
 
 		 736 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  24.47 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  36.53 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  25.49 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  33.15 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  32.43 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  29.06 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.51 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  25.35 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  33 
 
 		 761 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  31.82 
 
 		 725 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  32.12 
 
 		 739 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  31.35 
 
 		 728 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  32.22 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.97 
 
 		 739 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  30.59 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  30.16 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  31.12 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  32.07 
 
 		 749 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  32.8 
 
 		 744 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  28.52 
 
 		 735 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  31.12 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  30.39 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  21.67 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  24.46 
 
 		 813 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  31.38 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  32.6 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  29.79 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  34.46 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  34.5 
 
 		 728 aa  65.1  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.59 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  32.78 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  31.49 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  33.73 
 
 		 698 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  24.76 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  28.71 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  24.76 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>