More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1619 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1550    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  30.41 
 
 		 728 aa  225  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  28.83 
 
 		 719 aa  224  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  30.51 
 
 		 738 aa  223  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  28.61 
 
 		 728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.02 
 
 		 737 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.27 
 
 		 727 aa  220  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  28.32 
 
 		 786 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  27.35 
 
 		 750 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  27.15 
 
 		 735 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  28.64 
 
 		 744 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  29.14 
 
 		 728 aa  218  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  28.13 
 
 		 739 aa  218  5e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  29.07 
 
 		 731 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  29.99 
 
 		 724 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  29.58 
 
 		 742 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.53 
 
 		 733 aa  216  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  29.07 
 
 		 726 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  26.24 
 
 		 736 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.44 
 
 		 742 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.87 
 
 		 746 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  30.08 
 
 		 738 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  27.21 
 
 		 728 aa  211  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  28.1 
 
 		 749 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  27.14 
 
 		 727 aa  211  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  27.42 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  26.47 
 
 		 733 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  26.62 
 
 		 733 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  28.02 
 
 		 746 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.34 
 
 		 762 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  28.18 
 
 		 736 aa  205  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  28.64 
 
 		 728 aa  205  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  29.54 
 
 		 731 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.6 
 
 		 728 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  25.74 
 
 		 813 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  27.19 
 
 		 768 aa  200  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  27.41 
 
 		 744 aa  200  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  26.79 
 
 		 754 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  27.41 
 
 		 749 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  26.64 
 
 		 784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  26.27 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.51 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  29.75 
 
 		 744 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.45 
 
 		 731 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  31.03 
 
 		 742 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  27.48 
 
 		 715 aa  197  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  26.22 
 
 		 740 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  29.6 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  27.45 
 
 		 739 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  26.04 
 
 		 750 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  27.15 
 
 		 710 aa  194  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.02 
 
 		 741 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  28.94 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  29.06 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  29.62 
 
 		 722 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  27.33 
 
 		 740 aa  191  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  27.35 
 
 		 738 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.55 
 
 		 731 aa  190  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  26.98 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.4 
 
 		 731 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  28.85 
 
 		 735 aa  188  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  27.71 
 
 		 806 aa  188  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.68 
 
 		 744 aa  187  7e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  27.05 
 
 		 688 aa  187  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.49 
 
 		 825 aa  187  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  25.56 
 
 		 742 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.76 
 
 		 778 aa  185  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  26.76 
 
 		 778 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.76 
 
 		 778 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  26.96 
 
 		 732 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  26.99 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  26.76 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  26.55 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  26.76 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  26.62 
 
 		 778 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  26.62 
 
 		 770 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  26.89 
 
 		 778 aa  181  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.65 
 
 		 698 aa  181  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  27.74 
 
 		 719 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  27.04 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  28.97 
 
 		 871 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  26.47 
 
 		 778 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  25.58 
 
 		 698 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  26.74 
 
 		 825 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  26.74 
 
 		 825 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  26.1 
 
 		 741 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  27.02 
 
 		 834 aa  177  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  27.52 
 
 		 772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  25.44 
 
 		 686 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  26.55 
 
 		 726 aa  174  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  26.72 
 
 		 736 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  25.21 
 
 		 772 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.06 
 
 		 740 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  28.1 
 
 		 745 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  25.29 
 
 		 740 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  26.27 
 
 		 810 aa  159  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.5 
 
 		 659 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.67 
 
 		 833 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  27.83 
 
 		 719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.04 
 
 		 742 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>