180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11171 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 486 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  57.96 
 
 		 491 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  56.43 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  56.09 
 
 		 483 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  56.03 
 
 		 481 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15131  exodeoxyribonuclease V  57.51 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  31.26 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  26.25 
 
 		 678 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  26.11 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.23 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  23.54 
 
 		 754 aa  76.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  32.09 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  26.02 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  24.47 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  24.7 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  28.32 
 
 		 924 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  28.32 
 
 		 924 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.08 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  24.32 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.35 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  35.48 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  36.13 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  31.66 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  30.1 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  24.91 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  24.46 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  31.55 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  30.65 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  31.16 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  30.21 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  31.03 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  26.73 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  31 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.53 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  30.54 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  30.54 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  30.65 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  34.59 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  31.21 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  28.21 
 
 		 372 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  29.06 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  27.69 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  27.69 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.4 
 
 		 1112 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  29.63 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  24.18 
 
 		 772 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  29.81 
 
 		 742 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  24.79 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  30.15 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.89 
 
 		 576 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  29.65 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  32.3 
 
 		 762 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  29.86 
 
 		 1214 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  29.19 
 
 		 741 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  27.8 
 
 		 373 aa  53.9  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  24.47 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  27.8 
 
 		 373 aa  53.5  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 737 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  29.81 
 
 		 742 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  29.48 
 
 		 761 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  27.8 
 
 		 373 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3010  AAA ATPase  24.95 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  31.21 
 
 		 1665 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.39 
 
 		 727 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  30.35 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  27.61 
 
 		 698 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  24.64 
 
 		 566 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  24.64 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  31.65 
 
 		 739 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.87 
 
 		 721 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  30.88 
 
 		 653 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  30.41 
 
 		 749 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  31.01 
 
 		 744 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  30.13 
 
 		 870 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.5 
 
 		 641 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  32.33 
 
 		 659 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.22 
 
 		 698 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  29.76 
 
 		 726 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1955 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  28.66 
 
 		 750 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  28.03 
 
 		 728 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.93 
 
 		 728 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01029  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.17 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.539328  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  27.34 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  29.94 
 
 		 735 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  27.98 
 
 		 738 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  34.48 
 
 		 744 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  34.48 
 
 		 744 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  29.11 
 
 		 711 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25 
 
 		 740 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  26.81 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  29.81 
 
 		 746 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  30.48 
 
 		 743 aa  48.1  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.82 
 
 		 744 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  35.29 
 
 		 730 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  29.1 
 
 		 688 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  37.04 
 
 		 742 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  28 
 
 		 813 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>