142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5834 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  100 
 
 		 462 aa  964    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0741  exodeoxyribonuclease V  29.61 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.384305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  29.91 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0679  hypothetical protein  29.69 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  30.25 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  31.26 
 
 		 486 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15131  exodeoxyribonuclease V  29.41 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.4 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  25.15 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  24.08 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  28.43 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  26.09 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  24.3 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  25.77 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  24.09 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  30.39 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  27.09 
 
 		 469 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.81 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  24.68 
 
 		 754 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  29.76 
 
 		 659 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  25.44 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  29.84 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  30.06 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3625  AAA ATPase  23.4 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  23.58 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  34.19 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  30.99 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  26.26 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  32.26 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  25.18 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  31.61 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.43 
 
 		 744 aa  55.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  31.61 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  33.33 
 
 		 686 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  24.78 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  29.87 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  31.61 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  30.38 
 
 		 372 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  31.18 
 
 		 375 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  29.08 
 
 		 739 aa  53.9  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  23.31 
 
 		 741 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  21.81 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  29.85 
 
 		 728 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  28.87 
 
 		 761 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  27.27 
 
 		 1936 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  23.24 
 
 		 924 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  23.24 
 
 		 924 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  26.7 
 
 		 737 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  28.93 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  27.62 
 
 		 728 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  30.88 
 
 		 1214 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  31.25 
 
 		 782 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  28.88 
 
 		 875 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  30.38 
 
 		 710 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.4 
 
 		 728 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  32.3 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  22.55 
 
 		 653 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  23.28 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  32.52 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  29.11 
 
 		 731 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  33.15 
 
 		 574 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27 
 
 		 1955 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.11 
 
 		 573 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3707  ATPase  30.86 
 
 		 1277 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.405586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  30.3 
 
 		 372 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.13 
 
 		 740 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  24.64 
 
 		 735 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  29.17 
 
 		 375 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  29.44 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.86 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  31.45 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  32.52 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  29.28 
 
 		 768 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  28.57 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  28.41 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  21.19 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  26.32 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.95 
 
 		 698 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  24.58 
 
 		 733 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  28.83 
 
 		 782 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  28.83 
 
 		 782 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  33.33 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  21.19 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  28.83 
 
 		 782 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  28.45 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  29.1 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  22.3 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  30.3 
 
 		 740 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  26.9 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  25.36 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  28.11 
 
 		 698 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.5 
 
 		 576 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  23.09 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  27.39 
 
 		 614 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  28.96 
 
 		 745 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  29.95 
 
 		 747 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>